贼军攻打潼关时，朝廷任命前京兆尹萧廪为东道转运粮料使；萧廪称病，请求退休，被贬为贺州司户（贺州：今广西贺州，汉代苍梧郡的临贺县，吴国设置临贺郡，唐朝设置贺州，在京城东南四千一百三十里）。
黄巢进入华州，留下他的部将乔钤镇守。河中留后王重荣向贼军请求投降。癸未日，皇上下制任命黄巢为天平节度使。
甲申日，任命翰林学士承旨、尚书左丞王徽为户部侍郎，翰林学士、户部侍郎裴澈为工部侍郎，两人都担任同平章事。任命卢携为太子宾客、分司东都。田令孜听说黄巢已经入关，担心天子责怪自己，就把罪名推到卢携身上并贬了他的官，推荐王徽、裴澈为宰相。当天晚上，卢携服毒自杀。裴澈是裴休的侄子（裴休在二百四十九卷宣宗大中六年有记载）。
百官退朝后，听说乱兵进入城中，纷纷四散逃窜躲藏。田令孜率领五百名神策军士兵护送皇帝从金光门逃出（胡三省注：长安城西面有三个门，从北往南第一门是开远门，第二门是金光门，第三门是延平门），只有福、穆、泽、寿四王以及几个妃嫔跟随，百官都不知道皇帝的去向。皇上日夜不停地奔驰，随从官员大多跟不上。皇驾离开后，士兵和街市上的百姓争相进入府库抢劫金银布帛。
傍晚时分，黄巢的前锋将领柴存进入长安，金吾大将军张直方率领几十名文武官员在霸上迎接黄巢。黄巢乘坐着装饰华丽的轿子，他的部下都披散着头发，用红绸束着，穿着锦绣衣服，拿着兵器跟在后面，披甲的骑兵像流水一样，物资粮草堵塞了道路，连绵千里不断。百姓夹道围观，尚让挨个告诉他们说：“黄王起兵，本来是为了百姓，不像李氏那样不爱你们，你们只管安心居住，不要害怕。”黄巢住在田令孜的宅第，他的部下长期做强盗，没享受过富裕的生活，看到穷人，常常施舍给他们。过了几天，就各自出去大肆抢掠，焚烧集市，街上到处都是尸体，黄巢也无法制止；他们尤其憎恨官吏，抓到的官吏都被杀了。
10 皇上向骆谷（今陕西周至西南）行进，凤翔节度使郑畋在路边拜见皇上（《考异》说：《续宝运录》记载：“戊子日，皇帝到达骆谷壻水驿，于是下诏给牛勖、杨师立、陈敬瑄，说这个月七日，已经到达骆谷壻水驿。”按这个月庚辰朔日，戊子是九日，而诏书说七日，是“九”误写成“七”。《实录》记载：“辛卯日，皇驾到凤翔，郑畋在路边等候拜见。”《旧郑畋传》说在斜谷等候皇驾。《新纪》记载：“辛卯日，到凤翔。丁酉日，到兴元。”按甲申日皇上离开长安，辛卯日才到凤翔，太慢了，丁酉日就到兴元，太快了。另外，从骆谷走不会经过凤翔和斜谷。大概是皇驾经过凤翔境内，郑畋前去拜见，不是在凤翔和斜谷）。郑畋请求皇驾留在凤翔。皇上说：“我不想靠近强大的贼寇，暂且到兴元去，征调军队以便收复京城。你在东边抵御贼军的锋芒，在西边安抚各蕃族，联合相邻的道，努力建立大功。”郑畋说：“道路堵塞，奏章报告难以传递，请求允许我根据情况自行处理事情。”皇上同意了。戊子日，皇上到达壻水（胡三省注：《九域志》记载：洋州兴道县有壻水镇，传说仙人唐公昉全家升天，他的女婿没能一起升天，于是用他的名字命名这条河；太荒诞了），下诏给牛勖、杨师立、陈敬瑄，告诉他们京城失守，暂且到兴元，如果贼军势力还很强大，就将到成都去，应该预先做好准备。
庚寅日，黄巢把留在长安的唐朝宗室全部杀光，一个不留。辛卯日，黄巢才进入皇宫。壬辰日，黄巢在含元殿称帝，用黑色的绸子画成帝王的礼服，敲响几百面战鼓代替金石乐器。登上丹凤楼，颁布赦书；国号为大齐，改年号为金统。说广明这个年号，去掉“唐”字的下半部分，加上黄家的“黄”字和“日”“月”，作为自己的祥瑞。唐朝三品以上的官员全部停职，四品以下的官员职位不变。立妻子曹氏为皇后（《考异》说：《实录》《黄巢传》说立妻子曲氏为皇后。现在依从《新传》）。任命尚让为太尉兼中书令，赵璋兼侍中，崔璆、杨希古都担任同平章事，孟楷、盖洪为左右仆射、知左右军事（胡三省注：黄巢自己把他的军队分为左右），费传古为枢密使。任命太常博士皮日休为翰林学士（陆游《老学庵笔记》说：《该闻录》说皮日休投靠黄巢担任翰林学士，黄巢失败后，被处死；现在《唐书》采用了这件事。但尹师鲁写的《大理寺丞皮子良墓志》说：“曾祖父皮日休，躲避广明年间的战乱，迁居到会稽，依附钱氏，官至太常博士，追赠礼部尚书。祖父皮光业，是吴越的丞相。父亲皮璨，是元帅府判官。三代都以文章在江东称雄。”据此，皮日休并没有投靠黄巢担任他的翰林学士。小说荒诞不经，什么都有。尹师鲁的文章流传于世，而且他刚正有操守，不会欺骗后人）。崔璆是崔邠的儿子，当时他被罢免浙东观察使，在长安，黄巢找到他并任命他为宰相。崔璆在浙东的时候，本来就和黄巢有使者往来，还为他向朝廷上表奏请。
诸葛爽率领代北行营的军队驻扎在栎阳（今