当时齐明帝的病情已经很重，王敬则在东边突然起兵，朝廷震动恐惧。太子萧宝卷（后来的东昏侯）让人爬上屋顶，望见征虏亭（今江苏南京方山南）失火，以为王敬则到了，急忙整理行装想逃走。王敬则听说后，高兴地说：“檀公三十六策，走为上策，想来你们父子只有逃跑的份了！”（胡三省注：大概是当时人讥讽檀道济躲避北魏的话。）王敬则前来时，声势很大，没过几天就失败了（胡三省注：裁少日指不到二十天。）。
朝廷军队讨伐叛党，晋陵百姓因依附王敬则应处死的很多。太守王瞻上奏说：“愚民容易动摇，不值得都按法律严惩。”齐明帝同意了，得以保全性命的数以万计。王瞻是王弘之的堂孙（胡三省注：王弘之在晋朝做官，宋武帝征召他也不应。）。
齐明帝奖赏谢朓的功劳，升任他为尚书吏部郎（胡三省注：《唐六典》说：吏部郎负责选拔官员。魏、晋用人，善于适时选拔，各曹郎中功劳高的，升任吏部郎，历代品秩都高于其他曹郎。魏、晋、宋、齐，吏部郎为五品，其他曹郎为六品。）。谢朓上表三次辞让，齐明帝不允许。中书省怀疑谢朓的官职不够格辞让，国子祭酒沈约说：“近世小官不辞让，已成常俗。谢吏部现在被破格授予官职，辞让另有原因（胡三省注：谢朓从兼殿中郎升任吏部郎，所以说破格。谢朓以因岳父而得官为耻，所以说辞让另有原因。）。辞让出于人情，难道与官职大小有关吗！”谢朓的妻子常怀揣刀子想杀谢朓，谢朓不敢见她。
15. 秋季七月，北魏彭城王元勰上表请求用一年的封国俸禄、职俸、亲恤资助军国开支（胡三省注：国秩是彭城国的俸禄；职俸是元勰所任官职应得的俸禄；亲恤也是北魏朝廷给元勰用于抚恤亲属的费用。）。北魏君主下诏说：“牺牲自身保全国家，道理深远。职俸就停发，亲恤、国秩允许领取三分之一。”壬午日，又下诏削减皇后私府的一半开支，六宫妃嫔、五服以内男女的供给抚恤也减半，在军中的削减三分之一，以供给军队奖赏。
16. 癸卯日，任命太子中庶子萧衍为雍州刺史（胡三省注：为后来萧衍从雍州起兵埋下伏笔。）。
17. 己酉日，齐明帝在正福殿去世，享年四十七岁。遗诏说：“徐令可以重申前命（胡三省注：徐令指徐孝嗣。徐孝嗣任尚书令，建武四年加开府仪同三司，辞让不受）。沈文季可任左仆射，江祏可任右仆射，江祀可任侍中，刘暄可任卫尉。军政可委托陈太尉（胡三省注：陈太尉指陈显达。）；朝廷内外各种事务，无论大小委托徐孝嗣、萧遥光、萧坦之、江祏，重大事务与沈文季、江祀、刘暄商议（胡三省注：心膂之任指重要的职位。）。”
齐明帝性情猜疑多虑，很少外出，最终没去南郊祭天（胡三省注：天子即位后，应捧圭币到南郊拜见上帝。）。又深信巫师，每次外出都先占卜吉凶。往东出行却说往西，往南出行却说往北。起初生病时，严格保密，照常处理政务。很久后，敕令台省文簿中寻找白鱼作药，外界才知道。（胡三省注：《本草》说：白鱼味甘平，无毒；主治胃气，开胃下食，去水气，令人肥健。大的六七尺，色白，头昂，生活在江湖中。按这里在文簿中寻找白鱼，是所谓的蠹书鱼；《本草》叫衣鱼，也叫白鱼。有利小便，治疗偏风口喎。《衍义》说：衣鱼多在旧书中，久不动的衣帛中也可能有；身上有厚粉，用手抓粉就掉落。）太子即位。
18. 八月辛亥日，北魏太子从洛阳到悬瓠朝见。
19. 壬子日，奉朝请邓学率齐兴郡（胡三省注：齐武帝永明三年设置齐兴郡，属郢州，其地应在西阳、弋阳二郡境内。）投降北魏。
20. 北魏君主入侵时，派使者征发高车兵。高车人害怕远役，奉立袁纥树者为主，一起北叛。北魏君主派征北将军宇文福讨伐，大败而回，宇文福获罪被罢官。又命令平北将军江阳王元继都督北讨诸军事讨伐，从怀朔以东都受他调度，还代理镇守平城。元继是拓跋熙的曾孙（胡三省注：拓跋熙是道武帝的儿子。）。
21. 八月，把齐明帝葬在兴安陵（今江苏丹阳），庙号高宗。东昏侯讨厌灵柩放在太极殿，想尽快安葬，徐孝嗣坚决反对，才得以过了一个月。东昏侯每当该哭的时候，就说喉咙痛。太中大夫羊阐入宫哭丧，他没头发，大哭时俯仰起伏，头巾掉到地上，东昏侯停止哭泣大笑，对左右说：“秃鹙哭来了！”（胡三省注：《汉书·五行志》说：鹈鹕，或称秃鹙。颜师古说：鹈鹕一名淘河，腹下的皮囊大如