当初，谢晦和徐羡之、傅亮为保全自己谋划：认为谢晦占据长江上游，而檀道济镇守广陵，各有强大的军队，足以控制朝廷；徐羡之、傅亮在朝中掌权，可以长久维持。等到听说檀道济率领部众前来，惶恐害怕，无计可施。
檀道济到达后，和到彦之的军队会合，牵引船只沿着岸边前进。谢晦开始看到船只不多，轻视他们，不立即出战。到了晚上，借着风势扬帆而上，前后连接不断；西边的士兵离散沮丧，没有再战的心思。戊辰日，朝廷的军队到了忌置洲尾，（胡三省注：《水经注》记载：江水向东经过长沙下隽县北边，湘水从南边注入。又向东，左边有二夏浦，俗称西江口；又向东经过忌置山南，又向东经过彭城口。）排列船只渡过江，谢晦的军队一下子就溃散了。谢晦夜里逃出，投奔巴陵，乘坐小船返回江陵。
在此之前，皇帝派遣雍州刺史刘粹从陆路率领步兵骑兵袭击江陵，到了沙桥；（胡三省注：沙桥在江陵北边。）周超率领一万多人迎战，大败刘粹，士兵死伤超过一半。不久谢晦战败的消息传到。当初，谢晦和刘粹友好，任命刘粹的儿子刘旷之为参军；皇帝怀疑刘粹，王弘说：“刘粹没有私心，一定不用担心。”等到刘粹接受命令向南讨伐，毫无顾忌，皇帝因此称赞他。谢晦也没有杀刘旷之，把他送回刘粹那里。
丙子日，皇帝从芜湖东返。
谢晦到了江陵，没有其他安排，只是对周超感到惭愧道歉而已。当天夜里，周超舍弃军队独自乘船到到彦之那里投降。谢晦的部众几乎逃散完了，于是带着他的弟弟谢遯等七人骑马向北逃跑。谢遯肥胖，不能骑马，谢晦常常等他，走不快。己卯日，到了安陆延头（今湖北安陆西北），被戍主光顺之抓获，（胡三省注：戍主、戍副，宋、齐以后到隋都有这个官职。《姓谱》记载：光姓存在；《晋书》有光逸。）用囚车送到建康。
到彦之到了马头，何承天主动归附。到彦之于是监管荆州府事务，任命周超为参军；刘粹把沙桥战败的情况报告上去，于是逮捕了周超。于是诛杀谢晦、谢?、谢遯以及他们兄弟的儿子，连同同党孔延秀、周超等人。谢晦的女儿彭城王妃披头散发，光着脚，和谢晦诀别说：“大丈夫应当战死沙场，怎么能在都市里被处死！”庾登之因为没有参与谋划，被免官囚禁；何承天和南蛮行参军新兴人王玄谟等人都被宽恕。（胡三省注：根据《南史》记载：王玄谟是太原祁县人。汉建安二十年，收集塞下荒地设置新兴郡，魏黄初初年，迁到陉岭南边。王玄谟大概原本是新兴人而居住在太原祁县地界。）谢晦逃跑时，身边的人都抛弃了他，只有延陵盖跟随不舍，皇帝任命延陵盖为镇军功曹督护。（胡三省注：延陵是复姓，大概是吴延陵季子的后代；盖是他的名字；担任镇军府功曹，又兼任督护的官职。晋朝东迁后，有参军督护，功曹参军兼任督护，就是参军督护的职务。洪适说：参军督护，江左设置，都有部曲，宋时就没有了。）
谢晦起兵时，引来北魏南蛮校尉王慧龙作为援助。（胡三省注：北魏任命王慧龙为南蛮校尉，来骚扰汝水、颍水之间地区。）王慧龙率领一万部众攻下思陵戍，（胡三省注：思陵戍在陈郡西北。）进军包围项城，听说谢晦战败，才退军。
益州刺史张茂度接受诏令袭击江陵；谢晦战败后，张茂度的军队才到白帝（今重庆奉节东）。议论的人怀疑张茂度有二心，皇帝因为张茂度的弟弟张卲忠诚有气节，赦免他不追究，召他返回京城。
三月辛巳日，皇帝返回建康，征召谢灵运为秘书监，颜延之为中书侍郎，赏赐待遇非常优厚。
皇帝因为惠琳道人善于谈论，于是和他商议朝廷大事，惠琳道人于是参与权力中枢，宾客云集，门前常有几十辆车，（胡三省注：门车指在门前等候拜见的车。）四方的馈赠接连不断，宴席常常有七八桌，座上总是满的。惠琳道人穿着高底木鞋，披着貂皮裘衣，设置通呈、书佐。（胡三省注：通呈是掌管通报传达的官职；书佐是掌管文书的官职。）会稽人孔觊曾经拜访他，遇到宾客满座，只是寒暄了几句而已。（胡三省注：说只是问候冷暖，没有说别的话。）孔觊感慨地说：“竟然有黑衣宰相，可说是冠履颠倒了！”（胡三省注：庐陵王被废而三人被贬斥，徐羡之、傅亮被诛杀而三人被进用，可以说是矫枉过正了。）
夏季五月乙未日，任命檀道济为征南大将军、开府仪同三司、江州刺史，到彦之为南豫州刺史。派遣散骑常侍袁渝等十六人分别巡视各州郡县，考察官吏政绩，访求百姓疾苦；又让郡县各自报告政务的得失。丙午日，皇帝亲临延贤堂审理诉讼案件，（胡三省注：延贤堂