13六月，任命刘裕为太尉、中书监，加授黄钺；刘裕接受黄钺，其余的坚决辞让。任命车骑中军司马庾悦为江州刺史。庾悦是庾准的儿子。（胡三省注：刘裕为车骑将军，因刘敬宣征蜀失利，请求降号为中军将军，所以车骑、中军二府共有一个司马。庾准是庾亮的孙子。）
14司马国璠及弟弟司马叔璠、司马叔道投奔后秦。后秦王姚兴说：“刘裕正在诛杀桓玄，辅佐晋朝，你们为什么来？”他们回答说：“刘裕削弱王室，我们宗族中有自我振作的人，刘裕就除掉他们；他正要成为国家的祸患，比桓玄更严重。”姚兴任命司马国璠为扬州刺史，司马叔道为兖州刺史。
15卢循抢掠各县没有收获，对徐道覆说：“军队疲惫了，不如返回寻阳，合力夺取荆州，占据天下的三分之二，再慢慢与建康争夺。”秋季，七月，庚申日（初十），卢循从蔡洲向南返回寻阳，留下他的党羽范崇民率领五千人据守南陵（今安徽池州贵池，梁设置南陵郡及南陵县，在今繁昌附近）。（胡三省注：卢循担心战事有胜负，想南归番禺，所以让范崇民镇守来巩固彭蠡湖口。）甲子日（十四日），刘裕派遣辅国将军王仲德、广川太守刘钟、河间内史兰陵人蒯恩、中军谘议参军孟怀玉等人率领部众追击卢循。
16乙丑日（十五日），北魏主拓跋嗣返回平城。
17西秦王乞伏乾归讨伐越质屈机等十多个部落，（胡三省注：越质是鲜卑种族；他们的首领叫叱黎。叱黎的儿子叫诘归，孝武帝太元十六年投降乞伏乾归，太元二十一年反叛投降后秦。屈机就是诘归，语音稍有错误。）降服他们的部众二万五千人，迁徙到苑川。八月，乞伏乾归重新定都苑川。（胡三省注：乞伏氏本来定都度坚山，乞伏乾归强盛，开始定都苑川。被后秦打败后投降后秦，后秦让他镇守苑川，又反叛，担心被后秦袭击，返回保卫度坚山。现在部众逐渐强盛，不畏惧后秦，重新定都苑川。）
18沮渠蒙逊讨伐西凉，在马庙（祭祀马祖的地方）打败西凉世子李歆，擒获他的将领朱元虎后返回。西凉公李暠用二千斤银、二千两金赎回朱元虎；蒙逊归还他，于是与李暠结盟后返回。
19刘裕返回东府（胡三省注：卢循退走，刘裕才返回东府。），大规模整治水军，派遣建威将军会稽人孙处、振武将军沈田子率领三千人从海路袭击番禺。沈田子是沈林子的哥哥。众人都认为“海路艰难遥远，一定难以到达，而且分散现有兵力，不是眼前的急事。”刘裕不听，命令孙处说：“大军在十二月之交一定打败妖虏，你到那时，先摧毁他们的巢穴，使他们逃跑没有归宿。”
20谯纵派遣侍中谯良等人到后秦朝见，请求出兵讨伐晋朝。谯纵任命桓谦为荆州刺史，谯道福为梁州刺史，率领二万人侵犯荆州；后秦王姚兴派遣前将军苟林率领骑兵与他们会合。
江陵自从卢循东下后，得不到建康的消息，盗贼四起。荆州刺史刘道规派遣司马王镇之率领天门太守檀道济、（胡三省注：吴孙休永安六年分武陵设置天门郡。充县有松梁山，山上有石头，石头张开几十丈，很高，用弩向上射不到，上面叫天门，因此命名为郡。《舆地志》：澧州石门县，是古代的天门郡。）广武将军彭城人到彦之入援建康。檀道济是檀祗的弟弟。
王镇之到寻阳，被苟林打败。卢循听说后，任命苟林为南蛮校尉，分兵给他，让他乘胜讨伐江陵，声称徐道覆已经攻克建康。桓谦在路上招募旧部，（胡三省注：桓氏世代居住在荆楚，旧恩所结，情义不忘，称为义旧。）投奔他的百姓有二万人。桓谦驻守枝江（今湖北枝江，汉属南郡，春秋时的罗国，江水在这里向西分出为沱江，向东又汇入长江，所以叫枝江），苟林驻守江津（今湖北江陵南），二寇交相逼近，江陵士民大多怀有二心。刘道规于是召集将士告诉他们说：“桓谦现在就在附近，听说各位长者有离开或留下的打算，我从东边带来的文武官员足够成事；（胡三省注：东来文武，指刘道规随行的将佐士兵。）如果想离开，我不禁止。”于是夜里打开城门，到天亮都不关闭。众人都敬畏服从，没有离开的。
雍州刺史鲁宗之率领几千人从襄阳奔赴江陵。有人说鲁宗之的心意不可猜测，刘道规单骑迎接他，鲁宗之感动喜悦。刘道规让鲁宗之留守，把他当作心腹，自己率领各路军队进攻桓谦。各将佐都说：“现在远出讨伐桓谦，胜负难定。苟林近在江津，窥伺动静，如果来攻城，鲁宗之未必能坚守；万一有失误，大事就完了。”刘道规说：“苟林愚蠢懦弱，没有奇计，因为我离得不远，一定不敢攻城。我现在进攻桓谦，到了就能攻克；犹豫之间，已经返回。桓谦失败，苟林就会吓破胆，哪里有时间来！而且鲁宗之独自坚守，怎么会支撑不了几天！”于是驰往进攻桓谦，水