马援斩杀了徵侧、徵贰。
妖贼单臣、傅镇等人聚集起来，进入原武城（今河南原阳 ，原武县属河南尹 ），自称将军。刘秀下诏让太中大夫臧宫率兵包围他们，多次攻打都没有成功，士兵死伤众多。刘秀召集公卿、诸侯王，询问应对的策略，大家都说：“应该加大悬赏。”只有东海王刘阳说：“这些妖贼是被巫师裹挟在一起的，势必无法长久，他们当中肯定有后悔想逃跑的人，只是因为外面包围得太紧，逃不出去罢了。应该稍微放松包围，让他们能够逃亡（贤良注解说：“挺”，是解除的意思 。我依据《礼记·月令》中“挺重囚” ），他们一逃亡，一个亭长就足以将其擒获。”刘秀认为他说得对，立即命令臧宫撤除包围，放松对贼军的围困，贼军果然开始分散。夏季，四月，汉军攻克原武城，斩杀了单臣、傅镇等人。
马援继续进军，攻打徵侧的余党都阳等人，一直打到居风（今越南清化 ，贤良注解说：居风，是县名，属九真郡，就是现在的爱州 。《交州记》记载：居风有座山，山里出产金牛，常常在夜里出现，光芒能照亮十里 。山上有个风门，常常刮风 ），迫使他们投降；岭南地区全部平定（贤良注解说：“峤”，指岭峤 。《尔雅》说：山又尖又高叫做峤。《考异》说：《马援传》写作“都羊”，《光武帝纪》写作“都阳”，现在依据《光武帝纪》 。又《光武帝纪》记载：“十八年四月，派马援攻打交趾。十九年四月，斩杀徵侧、徵贰等人，接着攻打都阳等人，迫使他们投降。”《马援传》记载：“十七年，被任命为伏波将军，讨伐徵侧、徵贰。十八年春，军队到达浪泊，第二年正月，斩杀徵侧、徵贰。”大概《光武帝纪》所记载的，是马援上奏攻破徵侧、徵贰以及将她们的首级送到洛阳的时间 。沈怀远《南越志》说：“徵侧逃入金溪穴中，过了两年才被抓获。”《马援传》的记载更接近事实，现在依据《马援传》 ）。马援与越人重新申明旧有的制度来约束他们，此后骆越人一直奉行马将军的规定（贤良注解说：“骆”，是越人的别名 。《林邑记》记载：日南卢容浦通向铜鼓外越 。铜鼓就是骆越；因为有铜鼓，所以得名 。马援取走铜鼓，用来铸造铜马 ）。
闰月戊申日，刘秀将赵、齐、鲁三公的爵位都晋升为王。
郭皇后被废后，太子刘强心里很不安。郅恽劝太子说：“长久处于被怀疑的位置，对上违背孝道，对下又接近危险的境地，不如辞去太子之位，去奉养母亲。”太子听从了他的建议，多次通过身边的人和各位王爷，诚恳地表达自己的意愿，希望能去做藩王。刘秀不忍心这么做，犹豫了好几年。六月戊申日，刘秀下诏说：“按照《春秋》的大义，立太子要立嫡长子中尊贵的那个。（《春秋公羊传》说：立嫡长子依据年龄长幼而不依据贤能，立庶子则依据母亲的尊贵地位而不依据年龄。齐桓公为什么尊贵？因为他母亲尊贵。母亲尊贵儿子就尊贵，儿子因母亲尊贵而尊贵，母亲也因儿子尊贵而尊贵。）东海王刘阳，是皇后的儿子，应该继承皇位。皇太子刘强，崇尚谦逊退让，愿意去做藩王，父子之间的感情，难以长久违背他的意愿。现在封刘强为东海王，立刘阳为皇太子，改名刘庄。”
袁宏评论说：设立太子，是为了重视宗族传承，统一民心，除非太子对天下犯下大错，否则不应该轻易更换。世祖中兴汉朝大业，应该遵循正道，为后世树立典范。如今太子的品德在外面并没有什么缺失，只是因为皇帝的宠妃增多，就将嫡子的太子之位变动，这可以说是失策。然而东海王刘强回到藩国后，谦恭的态度更加明显；汉明帝刘庄继承皇位后，对兄弟的情谊也更加深厚（《论语》中孔子说：唯有孝顺父母、友爱兄弟的人，才会对国家尽忠。）。虽然兄弟长幼的位置发生了变化，废立的情况不同，但父子兄弟之间的至情至性却没有隔阂。用夏、商、周三代的道德标准来看待这件事，也不过如此吧！
刘秀任命太子的舅舅阴识为执金吾，阴兴为卫尉，让他们辅佐教导太子。阴识为人忠厚老实，在朝廷上虽然直言进谏，但和宾客交谈时，却从不提