第二幕：未完成的受洗
吉田影明的镜片里，弃婴井的水面荡开涟漪。襁褓中的自己被神父扔进井里，脐带缠着的半枚念珠掉进水里，却在下沉时映出成年的自己——他没有穿教会的白袍，而是穿着染血的白大褂，胸口嵌着镜片，镜片里的“受洗池”不是圣水，是解剖台的福尔马林，池底沉着的，是他刻在肋骨上的“我是人的初稿”。
第三幕：叛徒的晶体
费尔南多神父的瞳孔里，“traitor”晶体正在崩裂。每道裂痕都通向记忆深处：母亲火刑柱上的笑、自己向幕府递交矿脉图的手、还有临终前看见的、标本箱里与蜡油纹路重合的毒矿晶体。当晶体碎成七片，每片都映着同一句话：“我背叛的不是神，是那个在海边听矿石说话的自己。”
第四幕：矿工的圣像
阿国婆婆的骸骨嵌在岩盐晶体中，矿镐头的残片指向天空。她的脸与三百尊爆炸的圣母像重叠，却渐渐变成所有矿工的脸——他们没有穿圣像的长袍，而是披着矿灰染白的粗布，手中握着的不是权杖，是滴着矿毒的矿镐，镐柄上刻着的“神的耳朵在矿石里”，此刻成了“我们的声音在矿石里”。
血色念珠滚出井口的瞬间，江户的晨钟响起。念珠表面的四幕残像随震动流转，最终在钟鸣里拼成完整的画面：天草雪的血手、吉田的镜片、费尔南多的银珠、阿国的矿镐，共同托举着一颗跳动的“心”——心的表面布满矿毒结晶，却在中心留出缺口，像在等待什么。
当第一缕阳光照在念珠上，缺口处突然迸出微光。那是天草雪的血珠、吉田的镜片反光、费尔南多的银水、阿国的岩盐晶体，在光里融合成新的符号——不是十字架，不是倒十字，是两个重叠的“人”字，彼此支撑着站在矿石上，头顶是被矿毒染蓝的天空，脚下是流着血的大地。
幕府密探发现念珠时，它正躺在弃婴井边的青苔上。带队的密探甲曾见过天草雪的血绘矿图、吉田的皮肤脉纹、费尔南多的银茧、阿国的爆炸圣像，此刻盯着念珠表面的残像，忽然想起母亲临终前塞给他的护身符——那是半枚银玫瑰念珠，和念珠上的银珠分毫不差。
“原来我们都在念珠里。” 他低语着捡起念珠，矿毒荧光顺着指尖爬上皮肤，却没有疼痛——残像里的天草雪对他笑，吉田的镜片映出他童年的脸，费尔南多的晶体在说“对不起”，阿国的矿镐在画十字。当密探们举起火把要烧毁念珠，却发现火焰在接触的瞬间熄灭，念珠表面的血痕反而更亮，像在告诉他们：
有些东西，不是火能烧掉的。比如天草雪的血，早已渗进矿脉，成为大地的一部分；比如吉田的光，早已随镜片碎片漂向大海，成为水手的引路灯；比如费尔南多的忏悔，早已凝在银珠里，等着被某个孩子捡起；比如阿国的怒吼，早已刻进岩盐，成为矿石的心跳。
当夜幕再次降临，血色念珠滚进弃婴井。水面荡开的涟漪里，四幕残像再次浮现，却渐渐融合成一个新的场景：海边的沙滩上，天草雪、吉田、费尔南多、阿国，还有无数矿工，围坐在篝火旁。他们没有祈祷，没有忏悔，只是笑着，用矿镐在沙滩上画十字——这次的十字没有尖端，只有四个平等的端点，像张开的双臂，拥抱彼此，也拥抱大地。
井水渗进念珠的缺口，带出细小的矿砂。那些砂粒在月光下显影，竟是阿国婆婆刻了一辈子的圣母像衣褶——只是衣褶里藏着新的纹路，不是神的慈悲，是凡人的故事：天草雪的血路、吉田的火、费尔南多的银茧、阿国的爆炸，还有所有在矿洞里流血的人，他们的名字，都藏在衣褶的褶皱里，等着被后来的风，轻轻翻开。
最终，血色念珠沉入井底，与费尔南多母亲的半枚念珠相遇。两枚珠子相触的刹那，矿毒荧光与银辉共振，在井底投出巨大的人影——那是个普通人，左手握着矿镐，右手攥着血珠，胸口嵌着镜片，脚边堆着岩盐与银茧，他的影子落在井壁，与当年刻下的“不洁”二字重叠，却在重叠的瞬间，将“不洁”蚀成“不朽”。
江户的雨水冲刷着弃婴井，血色念珠的荧光随水流向大海。每滴水里都映着四幕残像，却在汇入海洋时，变成无数颗细小的星砂——它们会随洋流漂向世界，会在某个清晨，被冲上海岸，被某个捡矿石的孩子拾起。那时，孩子会看见星砂里的光，听见星砂里的声音，那是凡人的低语：
“神啊，我们曾用血、用火、用银、用岩盐，向你索要答案。现在我们懂了——答案不在念珠里，不在圣像里，不在任何符号里。答案在我们彼此的手里，在我们流着血却依然跳动的心里，在我们哪怕粉身碎骨，也要一起活下去的勇气里。”
而这颗沉底的血色念珠，终将成为大地的一部分。它的表面会渐渐覆满矿砂，