宰相商议诛杀李锜大功以上的亲属，（胡三省注：大功指堂兄、堂弟、堂姐、堂妹；以上包括服丧一年的亲属。）兵部郎中蒋乂说：“李锜大功以上的亲属，都是淮安靖王的后代。（胡三省注：淮安王李神通的谥号是靖。）淮安王有辅佐创业的功劳，陪葬皇陵、在祖庙受祭祀，（胡三省注：李神通起兵响应义军，因功陪葬献陵，配享高祖庙庭。）怎么能因为后代子孙作恶而连累他呢！”又想诛杀李锜的兄弟，蒋乂说：“李锜的兄弟是前都统李国贞的儿子，（胡三省注：李国贞为朝廷而死，事情见二百二十二卷唐肃宗宝应元年。）怎么能让他断绝祭祀呢！”宰相认为说得对。辛巳（二十七日），李锜的堂弟宋州刺史李銛等人都被贬官流放。
十一月，甲申朔（初一），李锜被押到长安，皇帝到兴安门（今陕西西安市新城区大明宫遗址内），（胡三省注：唐大明宫南面五门，兴安门是西来第一门。）当面责问他。李锜回答说：“我起初没有谋反，是张子良等人教我的。”皇帝说：“你是元帅，张子良等人谋反，为什么不斩杀他们，然后入朝？”李锜无言以对。于是连同他的儿子李师回一同被腰斩。（胡三省注：《实录》记载：“诛杀李锜几天后，皇帝派遣中使带着两袭黄衣，命令有关部门收殓他的尸体和儿子，以平民的礼节安葬。”《国史补》说：“李锜被擒时，有一个侍婢跟随他。李锜夜里撕开衣襟自己书写掌管专卖的功劳，说被张子良出卖。告诉侍婢说：‘把这个系在带上。我如果能从容奏对，必定会成为宰相、杨益节度使；不能从容奏对，就会被处死。我死了，你必定能进入宫中，皇上必定会问你，应当把这个呈上。’等到李锜被处死，京城大雾三天不散，有人听到鬼哭。宪宗又得到帛书，很怀疑他有冤屈，拿出两袭黄衣赐给李锜和他的儿子，敕令京兆府收殓安葬。”按李锜骄横叛逆，有什么冤屈！现在依从《实录》。）
有关部门请求拆毁李锜祖先的坟墓和家庙，中丞卢坦上奏说：“李锜父子被诛杀，罪名已经抵偿了。从前汉代诛杀霍禹，不牵连霍光；（胡三省注：诛杀霍禹见二十五卷汉宣帝地节四年。）前朝诛杀房遗爱，不牵连房玄龄。（胡三省注：诛杀房遗爱见一百九十九卷唐高宗永徽四年。）《康诰》说：‘父子兄弟，罪过不互相牵连。’（胡三省注：《左传》中晋胥臣引用《康诰》的话。现在《尚书·康诰》没有这句话。）何况因为李锜作恶而牵连到五代祖先呢！”于是没有拆毁。
有关部门没收李锜的家产送到京城。翰林学士裴垍、李绛上奏，认为：“李锜过度奢侈，搜刮六州百姓的财富来使自己家富裕，有的还枉杀百姓来夺取财物。（胡三省注：六州指润、睦、常、苏、湖、杭。）陛下怜悯百姓无处申诉，所以讨伐诛杀他，现在用车装载金银丝帛送到京城，恐怕会使远近的人失望。希望把叛贼的资产赐给浙西百姓，代替他们今年的租税。”皇帝赞赏感叹了很久，立即听从了他们的建议。
11昭义节度使卢从史，暗中与王士真、刘济勾结，表面上却献策请求谋取太行山以东地区，（胡三省注：当时魏博、恒冀在太行山以东。）擅自领兵向东出发。皇帝召他返回上党，卢从史借口到邢州（今河北邢台市）、洺州（今河北永年区东南）谋取食物，不按时奉行诏令；过了很久，才返回。（胡三省注：蒋阶《李司空论事》说：“李绛上奏：‘卢从史近来事情逐渐暴露很多，内心不安，一心想生事，所以歪曲陈述利害，频繁献上计策谋略，希望允许用兵来求得姑息。现在请求亲自率领兵马，想到邢州、洺州，借口谋取粮食，实际是为了调动部众。去留之际，情况可想而知。’”《旧唐书·卢从史传》说：“前年遭遇父亲丧事，朝廷旨意没有商议起用他。恰逢王士真去世，卢从史暗中献上诛杀王承宗的计策来迎合皇上的心意，因此被起用授官，委托他成就功业。等到下诏讨伐叛贼，军队出