9丁亥日，任命司列太常伯刘祥道兼右相，（胡三省注：司列太常伯就是吏部尚书。）大司宪窦德玄为司元太常伯、检校左相。（胡三省注：大司宪就是御史大夫。司元太常伯就是户部尚书。左相就是侍中。）
10冬季，十月，庚辰日，检校熊津都督刘仁轨上书说：“我看到现存的守兵，疲惫瘦弱的多，勇敢健壮的少，衣服破旧，只想着西归，无心效力。我问他们‘从前在海西，见百姓人人应募，争相从军，有的自己置办衣粮，称为“义征”，为什么今天士兵这样？’都说：‘今天官府和从前不同，人心也不一样。从前东西征战，为国而死，都蒙敕使吊祭，追赠官爵，有的把死者官爵回授子弟，凡渡辽海的，都赐勋一级。自显庆五年以来，征人多次渡海，官府不记录，死者也无人过问。州县每次征发百姓当兵，强壮富有的人，花钱行贿，都能逃避；贫困的人即使老弱，也被征发。前不久攻破百济及平壤苦战，当时将帅下令，许诺勋赏，无所不至；但到西岸后，只听说被枷锁囚禁，剥夺赏赐取消勋级，州县催逼，无法生存，公私困弊，难以尽言。因此上次从海西出发时就有逃亡自残的，不仅到海外才这样。另外，本来因征役获勋级是荣耀；但近年出征，都让勋官拉车，辛苦和普通士兵一样，百姓不愿从军，都因为这个。’我又问：‘从前士兵留镇五年，还能维持，如今你们才一年，为什么这样穷困？’都说：‘刚离家时，只让准备一年物资；现在已两年，没有归期。’我检查士兵剩下的衣服，今年冬天仅能应付，明年秋天以后，完全没有准备。陛下留兵海外，想消灭高丽。百济、高丽，过去互相支援，倭人虽远，也互相呼应，如果没有镇兵，会重成一国。如今既要镇守，又设屯田，靠的是士兵同心，而众人有这样的议论，怎能指望成功！如果不改革，厚加慰劳，明确赏罚来鼓舞士气，若还像以前那样处置，恐怕军队疲惫，难以成功。逆耳的话，或许没人向陛下尽说，所以我披肝沥胆，冒死上奏。”
高宗完全采纳他的意见，派右威卫将军刘仁愿领兵渡海替换旧镇士兵，还敕令刘仁轨一同返回。刘仁轨对刘仁愿说：“国家孤军海外，想谋取高丽，这事不易。如今收获未完，而军吏士兵一下子替换，将领也返回。夷人刚降服，人心不安，必定生变。不如暂且留下旧兵，逐步收割，备办物资粮食，分批遣返；将领暂且留下镇守安抚，不能返回。”刘仁愿说：“我前次回海西，遭很多谗言，说我多留士兵，图谋占据海东，几乎获罪。今天只知按敕令行事，怎敢擅自作为！”刘仁轨说：“臣子若对国家有利，知无不为，怎顾个人得失！”于是上书陈述利弊，自己请求留镇海东，高宗同意。又任命扶余隆为熊津都尉，（胡三省注：《考异》说：《实录》作“熊津都督”。按当时刘仁轨检校熊津都督，怎能再以扶余隆担任！明年，《实录》称熊津都尉扶余隆与金法敏结盟。现在依从这一记载。）让他招集残余部众。
11起初，武后能屈身忍辱，顺从高宗心意，所以高宗排除众议立她为后；到得势后，专擅作威作福，高宗想做什么，动辄被她牵制，高宗不胜愤怒。有道士郭行真，出入宫中，曾行厌胜之术，宦官王伏胜揭发。高宗大怒，秘密召西台侍郎、同东西台三品上官仪商议。上官仪于是说：“皇后专横，天下人不拥护，请废黜她。”高宗也认为对，立即命上官仪起草诏书。
左右侍从飞奔告诉武后，武后急忙到高宗处自诉。诏书草稿还在高宗那里，高宗羞愧退缩不忍心，又像以前一样对待她；还怕她怨恨，就骗她说：“我本来没这想法，都是上官仪教我的。”上官仪先前任陈王谘议，与王伏胜都曾侍奉原太子李忠，（胡三省注：李忠从陈王立为皇太子。王府谘议参军，正五品上，掌参谋议事。）武后于是让许敬宗诬告上官仪、王伏胜与李忠谋反。十二月，丙戌日，上官仪入狱，与儿子上官庭芝、王伏胜都被处死，家产抄没。戊子日，赐李忠死在流放地。（胡三省注：显庆五年，李忠迁到黔州（今重庆彭水）。）右相刘祥道因与上官仪交好，被罢去政事，任司礼太常伯，（胡三省注：司礼太常伯就是礼部尚书。）左肃机郑钦泰等（胡三省注：左肃机就是尚书左丞。）朝廷官员被流放贬官的很多，都因与上官仪有交往。
从此高宗每次处理政事，武后就在后面垂帘，无论大小政事，都参与知晓。天下大权，全归皇后，升降官员、生杀大权，都由她决定，天子只是拱手而已，朝廷内外称为“二圣”。（胡三省注：《考异》说：《唐历》记载：“群臣朝拜，各地表奏，都称二圣。皇帝坐在东间，皇后坐在西间。皇后随自己喜好，生杀由她决定。”按武后虽凶悍，怎会在高宗还在时，与高宗对坐接受群臣朝拜！绝不会这样。现在依从《实录》。）
12太子右中护、检校西台侍郎乐彦玮、（胡三省注：龙朔年间改左右庶子为左右中护。）西台侍郎孙处约都任同东西台三品。
麟德二年（乙丑、665）
1春季，正月，丁卯日，吐蕃派使者入朝拜见，请求再与吐谷浑和亲，还