3起初，太宗留侍中刘洎在定州辅佐皇太子，还兼任左庶子、检校民部尚书，总领吏、礼、户部三尚书事。（胡三省注：刘洎既检校民部尚书，又总领吏、礼，这是三尚书事，民部之外，哪能再有户部呢！《唐六典》记载：贞观二十三年，才改民部为户部。）太宗将要出发，对刘洎说：“我如今远征，你辅佐太子，关系到安危，应该深刻理解我的心意。”刘洎回答说：“希望陛下不用担心，大臣有罪的，我会立即诛杀。”太宗认为他说话轻率，很奇怪，告诫说：“你性格疏阔而太强硬，一定会因此失败，要非常谨慎！”等到太宗生病，刘洎从里面出来，神情很悲伤恐惧，对同事说：“病势这样，皇上的身体真让人担忧！”有人向太宗诬陷说：“刘洎说国家不值得担忧，只该辅佐幼主行伊尹、霍光之事，大臣有二心的就诛杀，自然安定。”太宗认为是这样，（胡三省注：因刘洎先前在太宗面前有诛杀有罪大臣的话，于是相信诬陷者的话是对的。）庚申（二十六日），下诏说：“刘洎和人私下议论，觊觎皇位，图谋执掌朝政，自比伊尹、霍光，（胡三省注：朝，指朝廷。处，指自居。）猜忌大臣，都想杀戮。应赐自尽，（胡三省注：赐自尽，就是赐死，让自己结束生命。《考异》说：《实录》记载：“黄门侍郎褚遂良诬陷上奏说：‘国家的事情不值得忧虑，只该辅佐少主行伊尹、霍光之事，大臣有二心的就诛杀，自然安定。’太宗病愈，下诏询问原因，刘洎按实际情况回答。褚遂良不停地作证。刘洎引用中书令马周来证明自己，太宗问马周，马周的回答和刘洎所说的一致。太宗以此责问褚遂良；褚遂良又作证说马周隐瞒，刘洎于是获罪。”按这种事一般人都不会做，褚遂良是忠直的大臣，而且一向没有怨仇，何至于这样！大概是许敬宗厌恶褚遂良，所以修《实录》时把刘洎的死归罪于褚遂良。现在不采用。）赦免他的妻子儿女。”
中书令马周代理吏部尚书，认为四季选官劳累，（胡三省注：四季选官开始于一百九十二卷元年。）请求恢复十一月选官，到三月结束；太宗听从。
4这一年，右亲卫中郎将裴行方（胡三省注：《唐六典》记载：隋氏左、右亲卫、左、右勋卫、左、右翊卫各设置开府一人，武德七年改开府，各设置中郎将一人，正四品下，掌管各自统领下属宿卫，且各自总管府事。）讨伐茂州（今四川茂县）反叛的羌人黄郎弄，大败他们，追击残余党羽，向西到乞习山（今四川阿坝州境内），临弱水（今四川西部黑河）而回。（胡三省注：蜀的西山有弱水。）
贞观二十年（丙午，646年）
1春季，正月，辛未（初八），夏州都督乔师望、右领军大将军执失思力等攻打薛延陀，大败他们，俘虏二千多人。多弥可汗率领轻骑兵逃走，国内骚动不安。
2丁丑（十四日），派遣大理卿孙伏伽等二十二人以六条（汉代考察地方官的六条标准）巡察四方，（胡三省注：以六条巡按州县，整肃纲纪、考察吏治。汉制：刺史以六条问事，不在六条范围内的就不察问。第一条，强宗豪右田宅超过规定，以强凌弱，以众欺寡；第二条，二千石不奉行诏书，不遵守典制，背公向私，假托诏令谋私利，侵害百姓，聚敛作奸；第三条，二千石不处理疑难案件，煽动杀人，发怒就滥用刑罚，高兴就随意赏赐，烦扰苛刻暴虐，剥削百姓，被百姓痛恨，导致山崩石裂，出现妖异谣言；第四条，二千石选拔官员不公平，偏袒自己喜欢的人，埋没贤才宠爱坏人；第五条，二千石子弟依仗权势，在自己监管的地方请托办事；第六条，二千石违背公正勾结，依附豪强，行贿受贿，损害政令。）刺史、县令以下官员多被降职罢免，那些到朝廷喊冤的人，前后接连不断。太宗命令褚遂良分类整理情况上