12辛亥（十八日），下诏：“国家刚建立的时候，宗庙的制度不完善，现在将要迁灵位合祭，应该让礼官详细商议。”谏议大夫朱子奢请求设立三昭三穆而空出太祖的位置。（胡三省注：昭，指宗庙中神位的排列次序。）于是增修太庙，把弘农府君和高祖以及旧的神主共四位改为六室。（胡三省注：弘农府君名重耳。）房玄龄等商议以凉武昭王为始祖。（胡三省注：凉王李暠谥号武昭。）左庶子于志宁商议认为武昭王不是帝王大业的源头，不能作为始祖；太宗听从了他的意见。
13党项人侵犯叠州（今甘肃迭部县）。
14李靖攻打吐谷浑的时候，用厚礼贿赂党项，让他们做向导。党项酋长拓跋赤辞前来，对各位将领说：“隋朝人不讲信用，喜欢掠夺我们。现在各位军队如果没有别的心思，我请求供给你们粮草；如果不是这样，我将占据险要地势堵塞各位军队的道路。”各位将领和他结盟后送他回去。赤水道行军总管李道彦行进到阔水（今四川松潘县附近），看到拓跋赤辞没有防备，袭击他，缴获几千头牛羊。于是各个羌人部落怨恨愤怒，驻守野狐峡，李道彦不能前进；拓跋赤辞攻打他，李道彦大败，死了几万人，退守松州（今四川松潘县）。左骁卫将军樊兴停留不前耽误了军期，士兵损失逃亡很多。乙卯（二十二日），李道彦、樊兴都因罪被减免死刑流放到边远地区。
太宗派使者到大斗拔谷（今甘肃民乐县东南）慰劳各位将领，薛万均诋毁契苾何力，自称是自己的功劳。契苾何力非常愤怒，拔刀站起来，想杀薛万均，各位将领阻止了他。太宗听说后，责备契苾何力，契苾何力详细说明了情况，（胡三省注：详细说明赤水之战从包围中救出薛万均兄弟以及被诋毁的情况。）太宗发怒，想解除薛万均的官职授予契苾何力，契苾何力坚决推辞，说：“陛下因为我的缘故解除薛万均的官职，各胡人部落无知，会认为陛下重视胡人轻视汉人，转而相互诬告，争斗一定会很多。而且让胡人认为各位将领都像薛万均，将会有轻视汉人的心思。”太宗认为他说得对就停止了。不久命令他在北门（玄武门）值宿警卫，检校屯营事务，（胡三省注：北门，指玄武门。根据《唐会要》，贞观十二年在玄武门设置左右屯营，由各卫将军统领，那里的士兵称为飞骑。契苾何力检校屯营，大概是贞观十二年以后的事，史书最终记载了这件事。）娶了宗室女儿临洮县主为妻。
15岷州都督、盐泽道行军总管高甑生延误了军期，李靖审查他。高甑生怨恨李靖，诬告李靖谋反，调查后没有证据。八月，庚辰（十七日），高甑生因罪被减免死刑流放到边远地区。有人说：“高甑生是秦王府的功臣，应该宽恕他的罪。”太宗说：“高甑生违背李靖的指挥，又诬告他谋反，这样都可以宽恕，法律将如何施行！而且国家从晋阳起兵以来，功臣很多，如果高甑生得到赦免，那么人人都将轻视法律，怎么还能禁止呢！我对旧功臣，从来没有忘记，因为这个原因不敢赦免啊。”李靖从此闭门谢绝宾客，即使是亲戚也不能随便见面。（胡三省注：以李靖侍奉太宗，还这样做，难道不是功成名就的时候难以自处吗！）
16太宗想亲自到园陵（指献陵，唐高祖李渊陵墓，今陕西咸阳市三原县），大臣们因为太宗悲伤过度身体瘦弱，坚决劝谏才停止。
17冬季，十月，乙亥（十二日），处月（西突厥的一个部落）第一次派使者入朝进贡。（胡三省注：处月、处密，都是西突厥的别部。）
18庚寅（二十七日），把太武皇帝（唐高祖李渊）葬在献陵，（胡三省注：献陵在京兆三原县东十八里。）庙号高祖；把穆皇后合葬，（胡三省注：太穆皇后窦氏，最初葬在寿安陵，现在合葬在献陵。）加谥号太穆皇后。
19十一月，庚戌（十八日），下诏商议在太原建立高祖庙。秘书监颜师古商议，认为：“宗庙应该在京城，汉代各郡国建立宗庙，不符合礼仪。”于是停止。
20戊午（二十六日），任命光禄大夫萧瑀为特进，又让他参与政事。（胡三省注：萧瑀停止参与朝政，见上卷贞观四年。）太宗说：“武德六年以后，高祖有废立的想法但没有确定，我不被兄弟容纳，实在有功高不被赏赐的恐惧。这个人，不能用利益诱惑