3三月，庚戌日初一，大规模核查户口，命令在当地定居的流民编入户籍（胡三省注：让西北士民侨居东南的，在所在之地以土着身份编入户籍），严格相关法制，称为《庚戌制》。
4皇帝相信方士的话，辟谷（不食五谷）服用丹药以求长生。侍中高崧劝谏说：“这不是天子应该做的；陛下做这事，实在是如同日月之食（犯错误）。”皇帝不听。辛未日，皇帝因为丹药发作，不能亲理朝政，褚太后再次临朝摄政（穆帝因年幼继位，褚太后临朝称制。升平元年，皇帝加冠，太后归政。皇帝即位时已年长，因疾病不能亲政，太后再次临朝）。
5夏季，四月，甲辰日，燕李洪攻打许昌、汝南，在悬瓠（今河南汝南）打败晋兵（胡三省注：《水经注》说：悬瓠城，是汝南郡治所。城的西北，汝水支流向左分出，向西北流，又折向西再向东转，又向西南汇入汝水，形状像下垂的瓠瓜，因此得名）。颍川太守李福战死，汝南太守朱斌逃到寿春，陈郡太守朱辅退守彭城（今江苏徐州）。大司马桓温派西中郎将袁真等人抵御，桓温率领水军驻扎在合肥（今安徽合肥）。燕人于是攻下许昌、汝南、陈郡，迁徙一万多户到幽、冀二州，派镇南将军慕容尘驻扎在许昌。
6五月，戊辰日，任命扬州刺史王述为尚书令。加大司马桓温扬州牧、录尚书事。壬申日，派侍中召桓温入朝参与朝政；桓温推辞不到。
王述每次接受职务，不做虚假的谦让，他所推辞的必定是不能接受的。等到担任尚书令，儿子王坦之对王述说：“按惯例应当谦让。”王述说：“你认为我不能胜任吗？”王坦之说：“不是，但能谦让自然是好事。”王述说：“既然认为我能胜任，为什么还要谦让！别人说你胜过我，看来一定赶不上我。”
7六月，秦王苻坚派大鸿胪授予张天锡大将军、凉州牧、西平公。
8秋季，七月，丁卯日，诏令再次征召大司马桓温入朝。八月，桓温到达赭圻（今安徽繁昌西北），诏令尚书车灌阻止他，桓温于是修筑赭圻城居住（胡三省注：赭圻在宣城界。《南史》记载，沈攸之从虎槛洲进攻赭圻，陶亮等人从鹊头领兵救援。刘昫说：宣州南陵县，是汉春谷县地；梁朝设置南陵县，旧治在赭圻城；唐朝长安四年，移治青阳城。按桓温《表》说：春谷县的赭圻城，在江东岸，临当濡须口上二十里，距建康宫三百三十里，南有声里，北有高安戍），坚决辞让录尚书事，遥领扬州牧。
9秦汝南公苻腾谋反，被处死。苻腾，是秦主苻生的弟弟。当时，苻生的弟弟晋公苻柳等还有五人，王猛对苻坚说：“不除去五公，最终必定成为祸患。”苻坚不听（为后来苻柳等人反叛埋下伏笔）（胡三省注：去，音qu）。
10燕侍中慕舆龙到龙城（今辽宁朝阳），迁徙宗庙和留守的百官都到邺城。
11燕太宰慕容恪准备攻取洛阳（胡三省注：《考异》说：《帝纪》记载“慕容暐侵犯洛阳”。上面说“苻坚别帅侵犯河南”。按明年，慕容恪攻下洛阳，苻坚亲自率兵防备潼关，是不敢和燕国争夺河南。《十六国春秋·苻坚传》也没有这事；《帝纪》恐怕有误），先派人招纳当地百姓，远近各坞堡都归附；于是派司马悦希驻军盟津（今河南孟津），豫州刺史孙兴驻军成皋（今河南荥阳西北）。
当初，沈充的儿子沈劲，因为父亲死于叛逆（见九十三卷明帝太宁二年），立志要立功来洗刷旧耻；三十多岁，因为是罪犯家属不能做官。吴兴太守王胡之担任司州刺史，上疏称赞沈劲的才能品行，请求解除禁锢，让他参与府中事务；朝廷批准了。恰逢王胡之因病，没有赴任。等到燕人逼近洛阳，冠军将军陈佑守卫洛阳，部众不超过二千人。沈劲自己上表请求配属陈佑效力；诏令任命沈劲补任冠军长史，让他自行招募壮士，得到一千多人前往。沈劲多次以少击多，打败燕兵。但洛阳粮尽援绝，陈佑自己估计不能坚守，于是以救援许昌为名，九月，留下沈劲率领五百人守卫洛阳，陈佑率领部众向东。沈劲高兴地说：“我的志向是为国捐躯（《论语》记载子张说：士见危致命。朱熹说：指献出生命，如同说授命），现在实现了。”陈佑听说许昌已经陷落，于是逃到新城。燕悦希领兵攻占黄河以南各城，全部夺取。
12秦王苻坚命令各公国分别设置三卿（胡三省注：晋朝制度：王国设置郎中令、中尉、大农为三卿；秦国沿用这一制度），其余官员都听任自行征召，只为他们设置郎中令。富商赵掇等人车服奢侈超越本分，各公国竞相引用他们为卿；黄门侍郎安定人程宪请求惩治。苻坚于是下诏说：“本来想让各公延揽选拔英才儒士，竟然却这样滥竽充数！应当让有关部门检查，征召不当的，都降爵为侯，从现在起国官都委托吏部选拔（胡三省注：铨衡，指吏部尚书）。除非有爵位的人，不得乘车马；离京城百里内，工匠商人奴仆，不得穿金戴银、穿锦绣，违者处死。”于是平阳、平昌、九江、陈留、安乐五公都降爵为侯。
兴宁三年（乙丑年，365年）
1春季，正月，庚申日，皇