建安九年，曹操攻克邺城，兼任冀州牧。有人向曹操建议：“应该恢复古代设置九州的制度，如此一来，冀州所管辖的地域就会十分广阔，天下人也会因此归服。”曹操打算采纳这个建议，荀彧却进谏道：“如果这样做，冀州将会得到河东、冯翊、扶风、西河、幽州、并州等地，涉及的地区和人口众多。之前您打败袁尚，擒获审配，此事震惊天下，各地的人必定都担心自己无法保住土地和军队。如今要是把这些地方都划归冀州管辖，他们肯定会人心惶惶。而且，有不少人劝说关右的将领们采取闭关自守的策略；如果他们听说了这件事，会认为自己的领地也会依次被夺走。一旦引发变故，即便有善于防守的人，也会在相互胁迫之下做出不法之事。这样一来，袁尚就能得到喘息的机会，袁谭也会心怀二心，刘表则能继续据守江、汉之间，那时想要谋取天下就更加困难了。希望您赶紧率军先平定河北地区，然后修复旧都洛阳，再向南进军荆州，责问刘表为何不向朝廷进贡。如此，天下人就都能明白您的心意，人心也会安定下来。等天下完全平定之后，再商议恢复古代制度的事情，这才是对国家长治久安有利的做法。”曹操听后，便搁置了恢复九州制度的提议。
当时，荀攸常常担任曹操的主要谋士。荀彧的兄长荀衍以监军校尉的身份镇守邺城，都督河北地区的事务。曹操征讨袁尚的时候，高干暗中派兵企图袭击邺城，荀衍提前察觉，将这些叛军全部诛杀，因功被封为列侯。（《荀氏家传》记载：荀衍字休若，是荀彧的三哥。荀彧的四哥荀谌，字友若，其事迹在《袁绍传》中有记载。陈群与孔融谈论汝、颍地区的人物时，陈群说：“荀文若（荀彧）、公达（荀攸）、休若、友若、仲豫，在当今世上无人能与之相比。”荀衍的儿子荀绍，官至太仆。荀绍的儿子荀融，字伯雅，与王弼、钟会都很有名，担任过洛阳令，还参与过大将军府的军事事务，他与王弼、钟会讨论《易经》《老子》的义理，相关内容流传于世。荀谌的儿子荀闳，字仲茂，担任太子文学掾。当时有甲乙两种不同的观点引发争议，荀闳与钟繇、王朗、袁涣各自持有不同的看法。魏文帝曹丕给钟繇写信说：“袁涣、王朗都是国中杰出的人才，相互呼应。荀闳刚猛强悍，如同往来冲击的精锐之师，实在是您的强劲对手，也是身边值得忧虑的人物。”荀闳最终官至黄门侍郎。荀闳的从孙荀辉（“恽”同“辉” ），字景文，担任太子中庶子，也很有名气。他与贾充共同制定音律，还撰写了《易集解》。仲豫名叫荀悦，是郎陵长荀俭的小儿子，荀彧的堂兄。张璠的《汉纪》称赞荀悦清净淡泊、沉稳安静，擅长着述。建安初年，荀悦担任秘书监、侍中，奉诏删改《汉书》，写成《汉纪》三十篇，他通过叙述历史事件来评判人物的善恶，内容详实且有法度，这本书在当时广为流传。）曹操将女儿许配给荀彧的长子荀恽，后来荀恽的妻子被称为安阳公主。荀彧和荀攸在朝中地位尊贵显要，但他们为人谦逊、生活节俭，将俸禄和赏赐都分给宗族亲友和旧相识，家中没有多余的钱财。建安十二年，曹操又给荀彧增加食邑一千户，加上之前的，共计两千户。（《荀彧别传》记载：曹操又上表说：“昔日袁绍侵犯京城周边地区，双方在官渡交战。当时我军兵力薄弱、粮食匮乏，我打算撤回许昌，写信与荀彧商议，荀彧没有同意我的想法。他提出应当坚守的建议，制定了继续进攻的策略，重新振奋了我的信心，改变了我的想法，于是我们最终打败了袁绍，击溃了他的大军。荀彧能洞察胜败的关键，这样的谋略世间少有。等到袁绍战败，我的粮食也快耗尽了，我认为河北地区难以图谋，想要南下征讨刘表。荀彧再次劝