随后，阿尔布克尔克宣布建立马六甲总督区，暂时属东印度总督管辖，他没有采纳部分极端水手的建议，没有过河拆桥，依然遵守了与非穆斯林族群的协约，为他们赋予了社区自治权，允许他们保留自己的信仰和自己的文化。
在阿尔布克尔克看来，印度教和佛教在进攻性与侵略性上远远不如伊斯兰教，与基督教之间也没有什么跨越千年的仇恨，伊斯兰教在印度洋沿岸传播千年，基督教势力要想坐稳江山，必须拉拢这些同样遭受伊斯兰压迫的地方宗教。
在这之中，阿尔布克尔克尤其青睐印度教，他认为这种宗教简直就是为外来统治者量身定制的统治工具，严格的种姓制度将整个族群的各个阶级割裂开来，只要能让中上层印度教徒承认东罗马的统治，他们自然会帮着镇压底层人民的不满。
但是，为了让他们和马六甲苏丹国进一步决裂，阿尔布克尔克将清剿穆斯林聚集区的“荣耀”全部交给了这些愿意妥协的非穆斯林群体，也承诺将三分之二的战利品分给他们，并用被俘的马六甲商船成立一个海洋商会，每个参与大清剿的地方势力都能参与其中。
在威逼利诱下，绝大部分的非穆斯林群体向穆斯林社区挥起了屠刀，一些信仰不深的穆斯林也急于通过改信来避免遭殃，一时之间，整座马六甲城血流成河，暗红色的水面上漂浮着一具具死尸。
那一段日子，罗伯特一直待在马六甲城，真正见识到了阿尔布克尔克的狠辣手段，看到了他是如何周旋在一个个地方势力之间，引起他们内心最深处的欲望，挑拨他们与穆斯林之间的矛盾，通过各种手段将这场血腥盛宴推向高潮，而他自己甚至没有留下任何一份正式的屠杀令，没有亲自向平民挥动过一次屠刀。
事情的结局可想而知，穆斯林政权在马六甲城的统治彻底垮台，阿尔布克尔克将最大的一座清真寺改建为圣保罗大教堂，其余清真寺也改建为印度教寺庙或佛教寺庙，东罗马殖民者代替了伊斯兰殖民者的地位，与愿意效忠的印度教势力以及佛教势力共同瓜分了穆斯林们留下来的遗产，将所有的反抗份子送去见了安拉，实现了快速稳定，干脆而利落。
不过，对于罗伯特来说，这种骇人听闻的暴行是他接受不了的，他只是个研究园艺的植物学家，和阿尔布克尔克终究不是一路人。
后来，罗伯特坐上了马六甲商会的航船，继续执行自己的任务，这个商会的主要舰船便是马六甲苏丹国遭到俘虏的东方式舰船，托庇在马六甲总督区的旗帜下，从事南中国海贸易，由印度裔商人和华裔商人实际控制。
这两种商人是马六甲苏丹国中最精明的一类人，是财富最多的一类人，也是遭受穆斯林压榨最深的一类人，阿尔布克尔克将原本独属于阿拉伯穆斯林商团的贸易特权授予了他们，立马获得了这些人的拥戴。
罗伯特知道，这些印度裔大多是来自印度南方的印度教徒，华裔群体的信仰则十分驳杂，尽管已经有些大商人为了迎合统治者而“受洗皈依”，他们也只不过是在祖宗，关公，妈祖，佛祖之后多加了一个耶稣基督的牌位，反正不要钱，多拜一个也没什么。
关于这些情况，阿尔布克尔克也不太想管，东罗马帝国注定不可能向这里大范围移民，印度洋的重心终究是印度次大陆，东罗马殖民者还得利用同为外来者的印度裔和华裔来压榨底层马莱人，他们只要不像原来的马六甲穆斯林那么逆反便完全足够。
“罗伯特先生，您还好吗？”
一个说着阿拉伯语的年轻小伙子走了过来，他叫阿南德，一个印度人，会说阿拉伯语，马莱语，汉语和日语，此次担任罗伯特的翻译官。
“我们马上就要到了。”
“还好，谢谢你。”
罗伯特点点头，露出一抹十分勉强的微笑。
他出生在昔兰尼加行省的托布鲁克城，父亲是个亚美尼亚裔，母亲是个柏柏尔裔，罗伯特一般会以希腊语作为主要交流语言，但他的阿拉伯语同样十分流利。
在这印度洋上，阿拉伯语就是主要商业交际语。
两个多月前，这支商船队开启了在马六甲总督区领导下的第一次商业活动，满载着胡椒，丁香等香料航向日本群岛，再从日本收购茶叶和丝绸，在阿尔布克尔克的安排下，罗伯特也成为了商人团的一员。
当然，罗伯特清楚，商船队将要购买的所谓“日本商品”多半来自大明，只是因为大明颁布了严厉的海禁政策，才导致部分走私贩将日本群岛上的不少岛屿当成货物囤积地。
“阿南德，我们前几天遇上的那些海盗，他们应该不会再来了吧？”
罗伯特想了想，看向阿南德，心有余悸地问道。
“他们到底是明国人，还是日本人？”
“都有，先生，从口音上听，那个领头的应该是出生在明国，高级水手