庚子（初三），韩宜妃孕，上亲祀夜明于夕月坛。
户部侍郎范应期请移驾南巡。
下廷议，无果。
癸卯（初六），以三年考满上，改云南新化直隶州知州孙继皋、四川参议顾宪成，除为翰林院修撰，兼中书舍人，值南京行在；以三年考满中上，升广东肇庆府同知余孟麟，为惠州府知府。
原职以中书舍人王应选、姚三让、张一坤按序补阙。
甲辰（初七），蒙古顺义王病笃，奏请修筑寺庙、汉城以祈福延寿，永安公主忠顺夫人朱轩姬附奏。
下廷议，乃赐水泥、木料等建材若干，赐寺名日大召，赐城名日呼和浩特，遣弘法等高僧三名，出关传经。
又以六年考满上，升右副都御使、兵部左侍郎、总督宣大陈栋，为右都御史、兵部尚书，总督三边，辖制陕、甘、宁、延，节制宣大，驻花马池。
乙已（初八），以辽镇将领招过女真降夷，下旨李成梁、杨五典等各赏银有差，赐降夷张为建州左卫指挥事。
命辽东总兵李成梁子如松，充五军都督府大元帅近卫，例推用。
丁未（初十），遣礼部尚书汪宗伊祭先师孔子，该年不予衍圣公祭赏。
以六年考满，升右副都御史总督漕运王宗沐，为右都御史、兵部左侍郎，总督辽东；改太仆寺卿蔡汝贤，为辽东巡按御史。
右副都御史顺天巡抚胡执礼，补阙漕运总督；五军都督府参谋御史郑宗学，补阙太仆寺卿。
癸丑（十六），上遣文武群臣，祭宋丞相文天祥。
礼部侍郎何洛文、林士章，刑部侍郎许国，请移驾南巡。
下廷议，无果。
甲寅（十七），万寿圣节，上御皇极殿，文武百官行庆贺礼，天下各王府及文武各衙门，进庆贺表。
该日，户部奏，以各省直清丈，多有未行册报，及议处未尽者，议行各抚按查核以报。
五军都督府奏，按例调京营神机营总兵焦泽，率战兵四营、车兵一营，合一万五千人，与南京兵备换防操练。
上是之。
户部尚书王国光、兵部尚书殷正茂、礼部尚书汪宗伊，奏请南巡，
下廷议，无果。
戊午（二十一），河南妖逆曹仑、王迁善、杨廷友于市而斩吉廷有等十二人，以左道妖术，
倡乱犯仪，挑拨民乱，冲撞衙署。
诏河南、浙江、江西三省按察使，回京听勘。
除司经局洗马李长春，为江西按察使；升国子监祭酒赵志皋，为河南按察使；起用故湖广巡抚赵贤，为浙江按察使。
庚申（二十三），以皇子生，上御皇极殿，群臣称贺。
上诏取内帑二万两，为宫中喜事赏用，并遣定国公徐文璧为正使，大学士申时行为副使持捧节册，册贵人吴氏为淑妃。
是日，文渊阁大学士申时行、东阁大学士王锡爵上疏。
新政壅阔，膏育成瘤。
其以江南为甚。金陵台省，尽南郊谪宦；士林结社，悉旧学，邪孽盘根，威福窃柄。内聚民乱以抗清丈，外托清议而割鼎祚，群情愤愤，豺声汹汹，谤汕乘舆，妖氛蔽野！
臣闻天子巡狩，所以考制度、正疆土、安兆民也。
轩辕之巡，祈神敬岳以镇方；夏后之迹，刊木导川而定域。昔舜禹行山而九鼎安，周穆省方而诸侯肃，所谓人主之所必巡，垂范万世也！
苏松二臣，顿首谨奏。
乃下廷议。
或日，三吴邦家血脉，江南社稷命门，岂得天日不降，皇威无被？
或言，太祖岁一临边，文帝五幸江左，武庙八骏万里，莫非祖制？
或曰，皇子出世，宜乘此大庆，明降德音于东西，弘敷惠泽于南北，此固结人心，培延国脉之大端也！
群臣伏从，百官附议。
辛酉（二十四），诏下文华殿，日：
成周营洛，肇启二都；有虞勤民，尤重巡省。朕君临天下，率彝典。然新政以来，横行，报禁但开，纲常毁裂。
江浙日请，銮舆按剑，苏松嗷，圣颜垂问，此非江南屋之所共盼？
乃于八月三十日，巡幸南京！
请慈圣皇太后、仁圣皇太后监国，司礼监掌印张宏、东厂提督李进、锦衣卫都指挥使徐文璧等，左右听用。
居守事重，仍命中极殿大学士张居正、都察院都御史海瑞、五军都督府左都督王崇古等，辅政监国，若唐太宗简辅监国必付房玄龄，卿等宜识朕此意，敬恭无怠。
惟文武除拜、四裔朝贡、军伍调发，上请行在外，余常务不必启闻。
命，文渊阁大学士申时行、东阁大学士王锡爵、副都御使陈吾德、六部侍郎姚弘谟、万恭、何洛文、李幼兹、许国、陈经邦、科道官等，扈从圣驾。
锦衣卫左都督朱希孝、锦衣卫右都督蒋克谦、五军都督府近卫统领骆思恭等，率