周主每次在宫中见宇文护，常行家人礼，按兄弟辈分。太后赐宇文护坐，周主站在旁边侍奉。丙辰日，宇文护从同州返回长安，周主到文安殿见他。趁机引宇文护进入含仁殿拜见太后，并且对他说：“太后年纪大，很爱喝酒，虽然多次劝谏，都没被采纳。兄长今天入朝，希望再劝谏。”于是从怀中拿出《酒诰》交给宇文护，说：“用这个劝谏太后。”宇文护进入后，按周主的吩咐读《酒诰》；没读完，周主用玉珽从后面打他（《礼记》记载：天子插珽。郑玄说：珽也是笏。珽的意思是挺直不屈。有人说就是大圭，长三尺，上端削薄，头部呈终葵形。终葵首是在削薄的上端又加宽头部像椎头。《隋志》记载：现在的制度，珽长一尺二寸、方形不折角，用球玉制作），宇文护倒在地上。周主让宦官何泉用御刀砍他，何泉惊慌，没砍伤。卫公宇文直藏在门内，跳出来斩杀宇文护。当时宇文神举等人都在外面，没人知道（史书说周主勇敢果断）。
周主召宫伯长孙览等，告知已诛杀宇文护，命令收捕宇文护的儿子柱国谭公宇文会、大将军莒公宇文至、崇业公宇文静、正平公宇文乾嘉（崇业、正平都是郡公。按《隋书·帝纪》，随州有崇业郡，但《志》没记载。《五代志》记载：绛郡正平县，旧设正平郡），及其弟弟宇文乾基、宇文乾光、宇文乾蔚、宇文乾祖、宇文乾威，连同柱国北地侯龙恩、龙恩的弟弟大将军万寿、大将军刘勇、中外府司录尹公正、袁杰、宇文护的都督李安等，在殿中杀死（长孙览是长孙稚的孙子，长孙稚在正光、永安年间有功名）。
当初，宇文护杀死赵贵等人后（宇文护杀赵贵等人之事见一百六十七卷高祖永定元年），侯龙恩被宇文护亲近，他的堂弟开府仪同三司侯植对龙恩说：“主上年轻，安危全靠几位公侯。如果多杀人来树立权威，不仅国家有累卵之危，恐怕我们宗族也会因此败亡，兄长怎能知而不言！”龙恩不听。侯植又趁机对宇文护说：“您以骨肉之亲，担当国家重任，希望对王室推心置腹，效仿伊尹、周公，那么天下万幸！”宇文护说：“我发誓以身报国，您难道认为我有别的志向吗！”又听说他之前和龙恩说的话，暗中忌恨他，侯植因忧虑而死。到宇文护败亡，龙恩兄弟都被处死，高祖（宇文邕）因侯植忠诚，特意赦免他的子孙。
大司马兼小冢宰、雍州牧齐公宇文宪，一向被宇文护亲近信任，赏罚之事，都能参与，权势很重。宇文护有什么要陈述的，多让宇文宪上奏，其中有时有不恰当的，宇文宪担心君主和丞相产生嫌隙，常常委婉表达，周主也察觉他的用心。到宇文护死后，召宇文宪入宫，宇文宪脱帽谢罪；周主安慰他，让他到宇文护府第收取符节和各种文书。卫公宇文直一向忌恨宇文宪，坚决请求诛杀他，周主不许。
宇文护的长子宇文训任蒲州刺史，当天夜里，周主派柱国越公宇文盛乘驿车征召宇文训，到同州，赐死（从蒲州西南到同州一百三十里，同州西南到长安二百二十五里）。昌城公宇文深出使突厥未回，派开府仪同三司宇文德携带玺书去杀死他。宇文护的长史代郡人叱罗协（叱罗是鲜卑复姓。魏收《官氏志》记载：拓跋内入诸姓有叱罗氏）、司录弘农人冯迁及亲信，都被除名。
丁巳日，大赦，改元（改元建德）。
任命宇文孝伯为车骑大将军，和王轨都加开府仪同三司。当初，宇文孝伯和周主同日出生，太祖（宇文泰）喜爱他，养在府中，幼年和周主同学。到周主即位，想召他到身边，借口要和宇文孝伯研习旧经，所以宇文护不怀疑，任命为右侍上士，出入卧室，参与机密事务。宇文孝伯为人沉稳正直忠诚，朝政得失，外面的小事，无不告知周主。
周主查阅宇文护的文书，有假托符命胡乱编造谋反言论的，都被处死；只找到庾季才的两页书信，大谈星象灾祥，建议归还政权，周主赐庾季才三百石粟，二百段帛，升任太中大夫。
癸亥日，任命尉迟迥为太师，柱国窦炽为太傅，李穆为太保，齐公宇文宪为大冢宰，卫公宇文直为大司徒，陆通为大司马，柱国辛威为大司寇，赵公宇文招为大司空（后周制度：三公九命，六官七命）。
当时周主开始亲理朝政，常用严刑，即使是骨肉也不宽恕。齐公宇文宪虽然升任冢宰，实际被剥夺权力。又对宇文宪的侍读裴文举说：“过去魏末朝纲混乱（不纲指君主不能掌握大纲，导致秩序混乱），太祖辅政；到周室受命，晋公（宇文护）又掌大权；积习成常，愚人认为理应如此。哪有三十岁的天子还能被人控制的！《诗经》说：‘夙夜匪懈，以事一人（《诗经·大雅·烝民》中的诗句）。’一人指天子。您虽然陪侍齐公，不能马上同他一样为臣，要为所侍奉的人效死。应以正道辅佐他，用义理劝诫他，使我们君臣和睦，兄弟团结，不要让他自己招