两人一兽离开后，李磊等人立刻开始加固封印。他们将黑暗将领与护法的本源结晶融入封印中，借助其中的力量增强封印的稳定性。同时，炎焚天在祭坛周围布置了十重炎灵大阵，灵曦圣女则种植了大量木灵仙草，用生机之力压制黑暗之力。
然而，他们不知道的是，在他们加固封印的同时，六大家族内部再次出现了问题。王家的残余势力联合白家的余孽，暗中勾结了黑暗祖神的另一支下属种族——“幽影族”，试图在凡域发动叛乱，牵制联盟的力量。
凡域牛家府邸中，牛啸天正在处理家族事务，突然收到蒋家传来的急报：“家主，王家余孽王浩率领幽影族修士突袭蒋家，蒋家族长蒋雄被围困，请求支援！”
牛啸天脸色一变：“王浩这个逆贼，竟然还敢兴风作浪！”他立刻召集牛家的混沌至尊道祖强者，“随我前往蒋家，斩杀叛逆，救援蒋雄！”
与此同时，李家与韩家也遭到了幽影族修士的袭击。李家族长李洪率领李家修士奋勇抵抗，但幽影族修士擅长隐匿与偷袭，李家损失惨重，多名半步至尊道祖修士陨落。
韩家族长韩涛则率领韩家修士退守韩家秘境，借助秘境中的防御阵法，暂时挡住了幽影族的攻击，但秘境的阵法也在幽影族的攻击下逐渐松动。
六大家族的内乱，让凡域陷入了混乱。而这一切，远在宇宙本源之地的牛凌天还一无所知。他与鸿蒙子、混沌兽已经抵达宇宙本源之地最深处，眼前出现了一座巨大的金色陵墓，陵墓上方笼罩着一层厚厚的鸿蒙阵法，正是鸿蒙祖神的陵墓。
“这就是鸿蒙祖神的陵墓，阵法中蕴含着祖神的残余力量，只有你能破解。”鸿蒙子说道。
牛凌天点了点头，运转体内的鸿蒙之力，朝着阵法走去。当他的手触碰到阵法时，阵法突然爆发出一道金色光幕，将他笼罩其中。光幕中，无数道鸿蒙符文涌入他的识海，正是破解阵法的密钥。
牛凌天按照符文的指引，运转鸿蒙之力，阵法逐渐打开一道缺口。就在这时，一道黑影突然从陵墓中冲出，手中利爪朝着牛凌天抓去：“牛凌天，本尊等候你多时了！”
牛凌天心中一凛，看清来人后，脸色凝重起来：“幽影族族长幽影侯（混沌至尊境后期巅峰）！你竟然在这里！”
“鸿蒙祖莲是祖神大人破封的关键，本尊怎能让你取走？”幽影侯冷笑一声，身形化作一道黑影，发动出其不意的偷袭。
鸿蒙子立刻出手，鸿蒙剑朝着幽影侯刺去：“休伤牛至尊！”
幽影侯侧身闪避，利爪朝着鸿蒙子抓去：“鸿蒙余孽，先解决你！”
两人瞬间战作一团，鸿蒙之力与幽影族的隐匿之力相互碰撞，虚空不断出现一道道黑影与金光。
牛凌天知道时间紧迫，趁着两人激战，快速进入陵墓。陵墓内部宽敞明亮，中央有一座巨大的莲台，莲台上生长着一株散发着金光的莲花，正是鸿蒙祖莲。
“终于找到了！”牛凌天心中一喜，刚要采摘鸿蒙祖莲，莲台下方突然出现一道黑色裂缝，无数道幽影族修士从裂缝中涌出，为首的是一名半步混沌至尊境的幽影将领。
“牛凌天，想要取走鸿蒙祖莲，先过我们这一关！”那名将领冷笑道。
牛凌天眼中闪过一丝杀意，混沌火灵之力与鸿蒙之力同时爆发，破邪枪一挥，数道金色枪气射出，将数十名幽影族修士斩杀：“挡我者死！”
他朝着莲台冲去，幽影族修士纷纷上前阻拦，但他们的修为在牛凌天面前不堪一击，被轻易斩杀。很快，牛凌天就来到莲台面前，伸手想要采摘鸿蒙祖莲。
就在这时，幽影侯突然摆脱鸿蒙子的纠缠，化作一道黑影，朝着牛凌天冲来：“给我留下！”利爪带着浓郁的死气，朝着牛凌天的后背抓去。
“小心！”鸿蒙子急忙喊道。
牛凌天心中一凛，侧身闪避的同时，反手一枪刺出，枪芒刺穿了幽影侯的肩膀。幽影侯发出一声惨叫，却依旧不肯放弃，利爪朝着鸿蒙祖莲抓去，想要将其摧毁。
“休想！”牛凌天一声怒喝，混沌火灵之力全力爆发，周身火焰暴涨，将幽影侯逼退。他趁机摘下鸿蒙祖莲，收入储物空间中。
“鸿蒙祖莲！”幽影侯眼中闪过一丝绝望，“没有鸿蒙祖莲，祖神大人就无法彻底破封，你该死！”他运转体内的黑暗之力，想要引爆本源核心，与牛凌天同归于尽。
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“不好！”鸿蒙子脸色大变，朝着幽影侯冲去，想要阻止他。
但已经来不及了，幽影侯的身体突然膨胀，一股恐怖的黑暗之力爆发出来。牛凌天与鸿蒙子被能量风暴震得连连后退，口中喷出鲜血。混沌兽见状，立刻挡在两人身前，雷火双翼全力扇动，形成一道屏障，挡住了大部分冲击。
能量风暴过后，幽影侯化为飞灰，陵墓也在冲击中摇摇欲坠。牛凌天脸色苍白，取出一枚药尊5级的鸿蒙破暗丹