建安四年，孙权跟随孙策征讨庐江太守刘勋。刘勋被打败后，他们又进军到沙羡讨伐黄祖。
建安五年，孙策去世，把事务都托付给了孙权，孙权痛哭不止。孙策的长史张昭对孙权说：“孝廉，现在难道是哭的时候吗？况且周公制定的礼法，伯禽却没有遵守，不是他想违背父亲，而是当时的情况不允许。” 臣松之按：《礼记?曾子问》中记载，子夏问孔子：“三年的丧期里，遇到战争可以不回避，这是礼的规定，还是当初有关部门的临时措施呢？” 孔子说：“我从老聃那里听说，从前鲁公伯禽就有过这样的事，是为了国家大事才这样做的。” 郑玄注释说：“周朝的人服丧满百日后就恢复正常工作。当时有徐戎作乱，伯禽服丧满百日后就出兵征讨，是为了紧急处理国家大事。” 张昭所说的 “伯禽不师”，大概指的就是这件事。“何况现在乱臣贼子争相作乱，豺狼般的恶人到处都是，你却想为亲人哀悼，顾及礼制，这就好比打开大门邀请盗贼进来，不能算是仁。” 于是孙权换下丧服，被人扶着上了马，出去巡视军队。当时，孙权只占有会稽、吴郡、丹杨、豫章、庐陵这几个郡，然而那些偏远险要的地方还没有完全归顺，天下的英雄豪杰分布在各州郡，客居在这里的士人把安危和去留放在心上，还没有形成稳固的君臣关系。张昭、周瑜等人认为孙权能够和他们一起成就大业，所以真心实意地辅佐他。曹操上表推荐孙权为讨虏将军，兼任会稽太守，驻守在吴地，派郡丞到郡里处理文书事务。孙权用对待老师的礼节对待张昭，而周瑜、程普、吕范等人则担任将领。他招揽优秀的人才，聘请有名的士人，鲁肃、诸葛瑾等人开始成为他的宾客。孙权分派各位将领，镇守安抚山越地区，讨伐不服从命令的人。《江表传》说：当初孙策上表推荐李术担任庐江太守，孙策去世后，李术不肯侍奉孙权，还收纳了很多孙权这边叛逃的人。孙权写信索要，李术回复说：“有德行的人就会有人归顺，没有德行的人就会有人叛离，不应该再归还了。” 孙权大怒，就把情况报告给曹操说：“严刺史从前被您任用，又是州里推荐的将领，而李术凶恶，轻率地违反汉朝的制度，残害州里的官员，肆意做残暴无道的事，应该迅速消灭他，来惩罚这类坏人。现在我想讨伐他，进可以为朝廷扫除像鲸鲵一样的恶人，退可以为严刺史报仇雪恨，这是天下公认的道义，我日夜都心甘情愿去做。李术一定会害怕被诛杀，又会用花言巧语求救。您所处的位置，担当着阿衡那样的重任，是天下人所敬仰的，希望您命令手下，不要再听信接受他的求救。” 这一年，孙权出兵在皖城攻打李术。李术关闭城门坚守，向曹操求救。曹操没有救援。皖城粮食耗尽，妇女们有的把泥做成丸子吞下去。孙权最终攻破城池，屠杀了城里的人，砍下李术的头示众，迁徙他的部下三万多人。
建安七年，孙权的母亲吴氏去世。
建安八年，孙权向西讨伐黄祖，打败了他的水军，只是城池没有攻克，而山寇又作乱了。返回时经过豫章，派吕范平定鄱阳，程普征讨乐安，太史慈统领海昏，韩当、周泰、吕蒙等人担任政务繁重的县的县令、县长。建安九年，孙权的弟弟丹杨太守孙翊被身边的人杀害，孙权用堂兄孙瑜代替孙翊的职位。《吴录》说：当时孙权大规模宴请官员，沈友发表了一些不同的意见，孙权让人把他扶出去，说：“有人说你想谋反。” 沈友知道自己不能脱身，就说：“主上在许都，有不把君主放在眼里的人，难道能说不是谋反吗？” 于是孙权杀了他。沈友，字子正，是吴郡人。十一岁时，华歆巡视风俗，见到他觉得与众不同，就招呼他说：“沈郎，可以上车谈谈吗？” 沈友犹豫着退后说：“君子交往，宴会要依照礼节，现在仁义衰败，圣道渐渐崩坏，先生奉命，将要用来弥补先王的教化，整顿风俗，却轻率地失去威仪，就像背着柴草去救火，恐怕会让火势更旺吧！” 华歆惭愧地说：“自从桓帝、灵帝以来，虽然有很多才德出众的人，但没有像这个小孩这样的。” 沈友二十岁左右就学识渊博，通晓很多知识，擅长写文章。同时喜欢军事