军医部负责建立军事医院，接收、治疗受伤士兵等相关医疗事务。
下辖组建军事医院，野战医院，医疗队等方面事务的军院司；
负责医生、护士选拔、培养、分配等方面的军医司；
负责受伤士兵后期康复、治疗方面的康复司等部门。
第十一部，军情部。
军情部负责刺探、了解、传递、调查、确认、分析各种军事情报等方面的责任。
军情部下辖暗探司；分析司等部门。
第十二部，功勋部。
功勋部负责对士兵和武官选拔、考核、升调、袭替、封赠、勋禄等方面的事务。
下辖考功司；勋爵司；勋禄司等部门。
第十三部，军校部。
军校部负责建立陆军、海军、空军、特种军、治安四大军种相应的军校，培养武将，培养后备人才。
下辖陆军军校司、海军军校司、空军军校司、特种军校司、治安校司、武官司、勋爵司等部门。
第十四部，军备司。
军备司主要负责研究更先进的军备武器，实现科技武备化，加强我军的武器装备的研发，进行技术的更新，国防科技战略管理，推动国防科技自主创新等事务。
下辖科研司；枪械司；火炮司；导弹司；军舰司；坦克司；飞机司；核武司等部门。
第十五部，退役部。
负责军队转业干部、复员军人、退役士兵的移交安置、服务管理、优待抚恤，以及烈士褒扬等工作。
下辖专业司；伤残司；退役司；抚恤司；追赠司；烈士陵园司等部门。
赵玄郎一口气介绍了武阁的详细情况，下辖的十五个部门，以及相关职权和责任。
目前，武阁的七位元帅暂定了四位，马承伟以次帅的身份总揽全局，王大山负责海军，程英鸿负责陆军，阿威负责治安部。
赵玄郎特意将内阁的阁老和武阁的元帅都只册封了少数几人，并没有一次性全部确定人选。
一来，赵玄郎麾下虽然已经坐拥六省之地，可人才还是比较少的，并没有多少个有足够能力和分量的人可以出任这些职位。
二来，赵玄郎也不可能在此时就将最高权力岗位全都抛出去，毕竟，此时的雷火军还只是一方诸侯势力罢了。
全国还有二十多个省份没有打下来，还有许多列强没有彻底赶走，还有大片失地没有收回来，日后，赵玄郎麾下的武将和文官还有大把大把的功勋可以获得，他可不想到那时那些人建立了功勋，他却封无可封。
反正，现在确定了这些人足以暂时盘活雷火军所在的六个省，让这六个省能够政令通达，按照他的意志进行革新、改造、发展就行。
随后，赵玄郎再次进行第三个大议题——雷火军治下的分级管理制度。
赵玄郎决定借鉴二十一世纪的制度，暂定雷火军总部— 省 — 市 — 县 — 乡镇五级管理体系。
接下来，赵玄郎又给众人讲述了雷火军第三阁，灵幻阁。
灵幻阁，负责灵幻界的一切事物，但凡涉及超凡之力的事务，灵幻阁都有权利插手，暂设阁主七人，正阁主一人，副阁主六人。
册封雷电法王石坚、一眉天师林九、龙虎山天师张静清三人为副阁主，负责灵幻界的所有事务，正阁主和其他副阁主位置空悬，日后补齐。”
灵幻阁下面也有着许多附属部门，以“殿”命名。
第一殿，功德殿。
功德殿，已经运行了一年多了，各种制度比较成熟，雷火军众人也都比较了解。
功德殿除了传授《功德金轮凝聚法》，按照功德金轮层数奖励功德点、任务大殿，兑换殿之外，还增加了一门针对普通人检查功德的职责。
日后，普通人如果感觉自己拥有功德，也可以提供一些相关资料，和一份检查资金，由功德殿检查他是否拥有功德。
如果这人有功德的话，可以直接免费获得《功德金轮凝聚法》的修行方法，凝聚出功德金轮，获得相应功德点，在功德殿接取任务，兑换灵物。
如果这人没有功德的话，《功德金轮凝聚法》肯定是没有了。
如果这人没有功德，也没有业力的话，那只是浪费了一份申请资金；如果这个人恰好有业力在身的话，就只能去治安部门报到，接受相应调查了。
功德殿依然由二叔公朱展元任殿主，暂时负责这方面的事务。
第二殿，祭祀殿。
祭祀殿主要负责在各地建立社稷众神，茅山祖师等神灵的宗祠与庙宇，选取庙祝，管理宗祠与庙宇，宣传众神，传承教义，为众神获取香火。
在这一点上，祭祀殿与内阁礼部祭祀众神的神祭司和祭祖司有些相似。
不过，礼部主要针对普通人；祭祀殿却基本上会有灵幻界的修士负责。
祭祀殿负责的众神之中，雷火天君赵玄郎