军机处继续发挥职能，设立军机大臣，皇帝担任一把手，凌驾于兵部和五军都督府之上，专门负责军事，军机大臣可以由内阁知兵的成员兼任。

    其余中央机构，依旧保持原样，内阁之下便是六部，六部尚书可由内阁成员兼任，其中兵部尚书必须是军机大臣。

    监察机构依旧保留都察院，都察院一把手左都御史必须是内阁成员，负责中央和地方的监察工作。

    东厂和锦衣卫继续保留，直接隶属于皇帝，现在大明百废待兴，朱慈烺不可能放下手中的这两把刀。

    确定好朝廷中央的框架之后，最重要的就是军队和地方的府治了，军队的变革是翻天覆地的。

    皇帝被确立为军队最高统帅，由京营改编而成的中央三大军团，直接隶属于皇帝和军机处，编制十万人。

    首先，便是取消地方都指挥使司和卫所，整编所有大明军队，仿照后世，将全国分为五大战区。

    设战区总司令，直接向军机处负责，负责执行朝廷的军令，统筹所辖区域的所隶属的大明军队。

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