对于地方官员，朱载坖也加以调整，原右都御史总督浙直等处军务事海瑞，以右都御史回都察院管事，署都察院事，原右副都御史巡抚南直隶杨继盛升右都御史总督浙直。

    协理京营戎政兵部左侍郎王崇古出镇宣大，加右都御史兼兵部尚书总督宣大等处军务事，原右都御史兼兵部尚书总督宣大山西曹邦辅调南京兵部尚书参赞机务。

    卫尉寺卿赵锦升兵部左侍郎协理京营戎政，原辽东巡抚张学颜升卫尉寺卿，原刑部尚书赵文华致仕，南刑部左侍郎洪朝选升刑部尚书。

    在朱载坖的一系列诏令之下，大明的官场仿佛被洗牌了一样，眼花缭乱的调动，让人局外人看不懂，但是局内人确实很明白。