赵家麟带领众人登上时空神殿，殿内的地面由流动的时空弦构成，每一步都能感受到强烈的时空波动。他们沿着殿内的通道走向时空本源晶核，沿途的墙壁上刻着上古时期的壁画——画面中，一群身披混元能量光芒的大能，正用自身能量修复受损的时空本源晶核，而他们的身后，是无数被时空浊流吞噬的世界。
“看来上古时期也曾发生过类似的危机。”光明圣女看着壁画，“他们用的方法应该就是三能合一，用混元能量净化时空浊流，修复时空弦。”
当众人来到时空本源晶核前时，黑色的时空浊流已经覆盖了晶核的一半，周围的时空弦开始变得暗淡。赵家麟深吸一口气，将混元能量注入本源混沌剑，剑尖释放出一道银色的能量光束，击中时空浊流。光束与浊流碰撞，发出刺耳的声响，浊流中的黑色能量被混元能量不断吞噬转化，逐渐退去。
但时空本源晶核的裂痕仍在扩大，需要更多的混元能量才能修复。墨尘、苏晴、光明圣女、凌霜、铁穹纷纷释放出自己的能量，注入赵家麟体内——墨尘的金属能量增强混元能量的韧性，苏晴的侦查能量提升能量的精准度，光明圣女的光明能量加速能量的融合，凌霜的冰雪能量减缓时空弦的断裂速度，铁穹的机械能量则稳定能量的输出。
赵家麟将所有人的能量与自身的混元能量融合，形成一道巨大的银色光柱，注入时空本源晶核。晶核内部的时空弦开始重新振动，裂痕处逐渐出现金色的修复纹路，黑色的时空浊流被彻底净化，转化为纯净的时空能量，融入周围的时空弦中。
就在晶核即将完全修复时，殿外突然传来一阵剧烈的震动——一只由时空浊流凝聚而成的“时空浊流巨兽”正撞击时空神殿的殿门，殿身的时空弦开始剧烈颤抖，随时可能崩塌。凌霜立刻带领铁穹返回混沌号，启动星核炮攻击巨兽；苏晴和墨尘则在殿内布置防御阵法，加固殿身的时空弦；赵家麟和光明圣女则继续向晶核注入能量，争取在神殿崩塌前完成修复。
时空浊流巨兽的攻击越来越猛烈，殿门的时空弦开始断裂，黑色的浊流涌入殿内。苏晴释放出所有的寻踪草幻境，暂时迷惑巨兽的视线；墨尘操控合金战甲变形为一道金属屏障，挡住浊流的冲击。就在这时，赵家麟终于完成了修复——时空本源晶核爆发出耀眼的银色光芒，一道巨大的时空能量波扩散开来，瞬间净化了殿内的浊流，同时将时空浊流巨兽彻底消散。
时空神殿在能量波的滋养下，殿身的时空弦重新变得璀璨，殿顶的时空本源晶核开始释放出稳定的时空能量，修复着混沌时空区受损的时空结构。赵家麟走到晶核前，指尖触碰晶核的瞬间，一股庞大的时空知识涌入他的脑海——他看到了宇宙时空的起源，看到了时空法则的形成，也看到了未来宇宙可能面临的危机：在宇宙的另一边缘，存在一个“反物质时空区”，那里的反物质时空弦正不断侵蚀正常时空，若不加以阻止，终将导致宇宙时空的失衡。
当众人返回混沌号时，时空本源晶核释放的能量已经在混沌时空区形成了一道稳定的“时空屏障”，将混沌时空区与正常时空分隔开来，同时不断向宇宙输送纯净的时空能量，修复着之前受损的时空结构。铁穹操控着混沌罗盘，定位到返回中元界群的时空节点：“我们该回去了，接下来还有更重要的事情要做。”
混沌号穿越时空通道时，赵家麟站在舰桥，望着窗外不断变幻的时空景象。他手中的本源混沌剑闪烁着混元能量的光芒，剑身上的时空符文与宇宙中的时空弦产生共鸣。他知道，修复时空本源晶核只是开始，反物质时空区的威胁已悄然临近，而他们的冒险，还将继续。
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当混沌号降落在中元堡垒的广场上时，各世界首领早已等候在那里。赵家麟将反物质时空区的危机告知众人，玄阳子翻阅上古残卷，发现上面果然有关于反物质时空区的记载：“反物质时空区乃宇宙诞生时的伴生时空，其反物质时空弦与正常时空弦相互排斥，若两者发生碰撞，将引发宇宙级的时空爆炸。”
接下来的日子，中元联盟开始为应对反物质时空区的威胁做准备。赵家麟带领修士们修炼混元能量，提升掌控时空弦的能力；铁穹则带领工匠们研发“反物质时空探测器”，用于监测反物质时空区的动态；苏晴和侦查队则前往宇宙边缘，寻找反物质时空区的准确位置。
这天，赵家麟站在中元堡垒的顶端，望着远处不断修复的时空防御阵。本源混沌剑在他手中闪烁着银色的光芒，与宇宙中的时空弦遥相呼应。他知道，新的危机已在酝酿，而他们，必须做好准备，守护好这片来之不易的和平。
苏晴突然从侦查舰上跳下，快步走到他面前，手中的探测器屏幕上显示着一道红色的时空坐标：