总督府作为地方割据政权的中央政府，由政务院、军务院和最高法院组成，实行行政、军事、司法三权分立。
其中政务院下辖组织部、财政部、外贸部、安全部、情报部、工业部、教育部、外交部，部长为正三品。军务院新增海军参谋部、陆军参谋部、装配部、后勤部、军训部，部长为正三品武官，与卫指挥使同品。
地方政府比如香城市政府归政务院管辖，海军和陆军以及民兵归军务院管辖，作战接受参谋部指挥，简而言之从上到下军政分析。军方的士兵招募训练、装备研发、后勤管理和战略规划，从带兵将领身上完全剥离，彻底断绝任何可能的拥兵自立和叛乱。
最后由最高法院负责对官员的监督和案件独立审理，像一把利剑一样悬在军政两院的上方，这是这个阶段刘香能想到的最佳组织架构。
至于其他下设的税务、专利、军情、劳动保障等业务，暂时挂在相应部门下方，但总的架子算是搭起来了。相应的人事任命，刘香牢牢把握在手郑朱荣调任组织部，原掌刑名的骨干科员李八元任大法官，其他也都有安排。
对于地方政府，则基本照搬后世的省市县架构，但给霖方政府高度自治的权利，未来台湾、吕宋、爪哇甚至澳洲等等省份，如果地方政府没有独立自主处理突发问题的能力，将是灾难性的。
刘香把自己的这套设计，直接写成了《大明海外总督府组织法》，务必做到有法可依。另外，还同时颁布了刑法、民法、商法、军法，将整个总督府治下规范起来。如果可以的话，他宁愿照搬大明的律法，只是他需要更适合工业化和科技社会的近现代法律，只能自己操刀。
更重要的是，他要用这种无处不在的律法，来打破所谓的皇权不下乡的潜规则。在他的地盘，绝对不允许有所谓的士绅行使家规族规，他刘香的规矩才是规矩！
这个时候，刘香再次放纵他的恶趣味，什么挨打不能还手、摔倒讹人都被他调教的明明白白。对方主动辱骂和动手，不存在互殴只有正当防卫。摔倒讹人同金额反坐罚款，还要剥夺子孙两代义务教育和科举权力。
虽然可能过犹不及，可刘香觉得有权不用过期作废，他的地盘他做主，总之要让自己气顺了！不要问他经历了什么，问就是不知道！
众人心知刘香在远东公司上让利很大，绝对不可能在总督府的组织上有任何不和谐的声音，于是全盘接受新的组织和律法。刘香留了几的过渡调整时间，将在六月初一正式开始实施。
第二公告开始张贴刘香对主要官员的封赏，看到名单上一个个正三品到五品的官员名字，所有人都是羡慕不已，尤其是那些南京来的士子们，差点都疯了！
那可是正三品啊！
大明多少官员一辈子也达不到的高度啊，这里居然批发似得一来就是一大把！什么时候官这么不值钱了？
一群士子把简志明围在中间问道，“志明兄，朝廷会承认这么胡闹的官员任命吗？”
简志明作为刘香的秘书长，总是知道一些内幕消息。
“这个，恐怕朝廷是会接受的。听大饶意思，海外总督府有直接任命官员的权利，朝廷只会在大人上报后在吏部备一下案，表示承认这个身份。但是朝廷一不会发放俸禄，二不会允许这些洒回朝廷，除非他们重新经过科举……”
“那也是朝廷的官啊！也是光耀门楣的好事啊！”
“能让我做到三品，一辈子在香城不回大明又如何？”
“大明官员的俸禄才多少啊？能跟总督府的比吗？”
“肃静！”，突然有一人大喊一声，然后拉住简志明问道，“志明兄，这次有没有你？”
周围的人也都一个个竖起耳朵，公告上面只列出了一些高官。
“在下不才，承蒙总督大人赏识，将出任总督府政务院秘书长，正五品。晨东兄则是军务院秘书长，同样也是正五品。”
简志明语气中带着自豪，他和好友毛晨东能够上位，凭的都是自己的努力。
“嘶，正五品啊！”
众人心中艳羡，都在心里暗暗鼓劲，一定要在几个月后的结业考试后超过他们。
“志明兄，这政务院和军务院是什么部门？”有人疑惑的问道。
“总督大人雄才大略，推行行政、军事、司法的三权分立，这政务院和军务院按在下的理解，就是大明的内阁和五军都督府，还有一个最高法院则是刑部和督查院的合体……”
士子们一边了解总督府的设置，一边憧憬着未来。
其余人虽然没有升官，也是跟着开心，因为官老爷们同时在城内大摆流水席，这家吃完吃那家，根本吃不完！居然有人开始制作了各家流水席用料和口味的排名，收到众人追捧。有被众人嫌弃的官员，面子上过不去，只好多花银子