不久，董卓属下—李傕、郭汜等人率兵攻入长安，杀死王允，吕布兵败逃亡。
李傕等人挟持汉献帝，专政四年，史称“李郭之乱”。
其间，凉州马腾与韩遂等也率军逼近长安，李傕派郭汜、樊稠及侄子李利于长平观击败马腾等人。
公元195年，由于李傕与郭汜等人内部不和发生内斗，分别挟持献帝与大臣，一时间长安陷入一片战乱。
7月，汉献帝离开长安，开始东归洛阳。
李傕与郭汜等人又联合起来，追击献帝，直到汉献帝派人与李傕、郭汜讲和才停止追击。
公元196年，献帝辗转流亡，回到已成废墟的旧都洛阳。
随后被曹操迎至许都，以汉献帝胁迫其他诸侯，史称“挟天子以令诸侯”。
隔年，郭汜被自己的部将—伍习杀死，李傕独据关中。
公元198年，曹操派裴茂率领段煨等关中诸将讨伐李傕，李傕被诛杀，至此关中初定。
这一系列事件，为曹操挟天子以令诸侯的始末，也是曹操率先称霸于一众诸侯的开端。
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在讨伐董卓之战结束后，各地方军阀对东汉朝廷已不加理会，转而发展各自的势力。
原董卓部下张济因军中缺粮，途径荆州南阳进行掠夺，结果在攻打穰城时战死。
其军队由侄子张绣继承后，反被荆州牧—刘表安置在宛城，联手驱逐袁术。
此事件为袁术被赶出南阳的缘由，进而转战豫州、扬州，从而促成了两大攻守同盟的开端。
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期间，孙坚在攻打刘表据有的襄阳时战死，其子孙策继承其部众。
在孙策投奔袁术后，向他借兵，从而带领孙坚旧部于公元196年到199年间在江东四处征战。
最后孙策独领江东，与刘表对峙，并等待时机北上中原。
期间，徐州陶谦病逝，屯兵小沛的吕布趁机夺取徐州。
公元197年，袁术于寿春称帝，国号“成”。
最后于公元199年，袁术被曹操、吕布、孙策三方联手攻灭，曹操遂得淮南。
此举使得吕布、孙策两方正式脱离袁术方的同盟，并为己方正名，此后诸侯混战中最黑暗的数年正式拉开序幕。
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公元194年，益州牧—刘焉病死，其子刘璋接任。
之后，刘璋与汉中张鲁决裂，双方开启长达八年的对峙。
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与此同时，在李傕败亡之后，马腾、韩遂等人则于凉州、雍州一带各自发展势力。
公元199年，公孙瓒困守易京，在穷途末路之下，最后被袁绍所灭。
一路东迁的吕布先是夺取曹操的兖州，在被被击败后先附陶谦，接着夺其领地徐州，最后被曹操于下邳抓获处死。
彼时，天下各州基本被一众更具实力的诸侯瓜分，按照如今的州郡划分分别是：
曹操占据兖州、豫州、雍州、徐州、淮州及南阳一郡，为天下第一。
袁绍占据青州、魏州、冀州、幽州，为天下第二。
刘渊占据云州、并州、朔州，为天下第三。
刘表占据荆州、湘州，独缺南阳一郡；
刘璋占据益州、宁州，独缺汉中一郡；
士燮占据越州、交州，独缺苍梧一郡；
此三方并列第四。
孙策占据江州；
马腾占据秦州；
韩遂占据凉州；
此三方并列第五。
张鲁占据汉中郡；
陈烈（陈霸先）占据苍梧郡；
此两方并列最末。
由是乎，天下被瓜分殆尽，大汉的声威垫落至谷底。
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之后，“衣带诏事件”发生，刘渊趁机向袁绍宣战。
紧接着，刘表也向曹操宣战，却因引起刘裕的不满而引发内乱。
由于袁绍抵挡不住刘渊的入侵，加之刘表一方的内乱使得曹操再无后顾之忧，随即便出兵北上。
自此，河北大战爆发，北方三强陷入混战的局面。
期间，交州也发生内乱，占据苍梧的陈烈起兵攻打士燮。
同时，孙策欲出兵北上偷袭许都，结果遭遇刺杀。
侥幸未死的孙策以一手假死之计，瞒天过海，暗中却是以雷霆手段迅速稳定内部。
之后，孙策趁中原空虚、荆州内乱之际，分兵两路出击。
孙策一路攻打淮南，周瑜一路攻打江夏，为江东开疆拓土。
曹操由于后院失火，险些退兵南下回援，最后被五谋士劝下。
于是，曹操上表天子，册封谢安牧于兖州、萧衍牧于豫州、桓温牧于徐州、钟繇牧于雍州，以