到了西平堡以后，孙元化又考察了一下，
感觉西平宝还不是最理想的地方，虽然有一个双台子河，而且水流量较少。
然后他又看了西宁堡靠近辽河，而且附近有几个河流，于是和马万军商量，就把西宁堡作为火器研究所的驻地，周围不允许有民众。
马万军同意了，把西宁堡的人搬迁到东昌堡和东胜堡。
孙元化在马万军的支持下，先在辽河上竖起了大大的水车，
用水力来锻造钢材，然后又用水利的推动造出了第一台车床和钻床。
准备打造枪管用。
当马万军把迫击炮的图形和工作原理以及炮弹的要求说出来以后，
孙元化就对这个新武器深深的迷上了。
安排好火器研究所的安置和安保工作。
马万军开始着手安排煤矿和铁矿的事情，
煤矿这一块儿，罗一贯和黑云鹤两个人和马万军配合的最默契的，
所以他们拿到马万军的地图以后，
就派兵攻占了细河的上游，（后世的阜新），那些地方其实还属于蒙古的管辖之内，
但是被黑云鹤铁骑，给赶跑了周围的牧民，
罗一贯派陈尚仁带领着辽东的难民，带上马万军设计的开采和口罩等防护工具，
开始了煤矿的开采。
孙承宗利用自己的影响力，把多名的采矿高手派来了，
这些人对煤矿、铁矿甚至金、银矿，都有丰富的经验，马万军派他们在鞍山驿的周边几座山上进行勘探，
几天后，再找到一座大山里的铁矿以后，
马万军就安排了新兵和辽东的难民开始了开采。
这些探矿的师傅还要走，就被马万军留了下来，
马万军对他们说“你们可以把自己的家眷全部接过来，每人给你们亩地，
而且永不收你们的税，另外，所有的勘探人员大匠给两银子的月份，小匠也给了十两银子的月份。
有了这些激励措施，所有的工匠都愿意留了下来。
这些人也为马万军等人后来开采倭寇国岛上的，金矿和银矿立下了汗马功劳。
一个月后，孙承宗和袁可立向朝廷要过来的万斤火药，都运到了西宁堡。
马万军可是知道这个东西的威力，立即派了士兵在仓库外面把守，
绝对不允许任何人带着可能点火的东西过进去，
进出都要严格的审查。
马万军和孙元化又交流了颗粒的火药制造方法，
孙元化专门从流民里面选出了一些细心的妇女，每个月三两银子的报酬，让她们开心万分的愿意做这项工作。
颗粒型火药在新的火雷的实验中，迸发出的威力比原来的火雷还要更具杀伤力。
等煤炭过来以后，马万军和孙元化，又开始了炼焦炭的实验，在辽河边建了几栋土窑，经过不断的尝试，终于练出了焦炭。
马万军虽然不懂钢铁，但是他知道风口越大，空气燃烧的越充分，钢铁的质量就会越好。
所以他和与孙元化又改进了炼钢的炉子，用后世的风箱和手摇式大型鼓风机、水力鼓风机等。
进行了不断的尝试，
经过了十几次的尝试，终于把标准炉和风机配好了。
练出来的钢锭，用水力的大锤打造以后，完全可以媲美原来的百炼钢，
孙元化高兴的说“我会把这些钢铁全部都造成优质的火枪，放心吧，这个绝对不会炸膛。
而且遂发枪的研究，我已经有些眉目了，这个米尼弹还是有点困难，
我们可以采取定装弹，这样也能减少时间。”
马万军说“好的，先这么进行试验，等鞑子灭掉了，我相信你们已经造出来新的子弹了。”
孙元化说“我们会不断的实验，放心吧！”
火器研究所这边已经上了轨道，马万军就松了一口气。
徐光启找到他，要求种植春季的红薯和玉米，
马万军在西平堡，所有的流民中，威望是最大的，
所以在他的保证下开始了种植。
马万军说“你们放心吧，这些不仅仅是粮食，我也会给你们想一种方法，
让你们去做生意，这个叫红薯，等夏季结束的时候就可以从地里拔出来，
只要用炉子烤过，以后会是非常香甜的小吃，到时候安排你们到京城和江南一些地方进行卖烤红薯，
像这么大的红薯，至少卖个钱。
你们想一想，你们每个人都有几十亩地，每亩几乎可以生产将近斤的红薯，
也就是说，光卖烤红薯，你们一年收入个一两百两银子是没问题的，
还有这个叫玉米，我也会给你们设计出来一个机器卖爆米花，这也是一种小吃，你们都是可以轻松的推一个小车叫卖。